Ana içeriğe atla

Ders Detayı

Ders Tanımı

DersKoduYarıyılT+U SaatKrediAKTS
BİYOENFORMATİKTE SEÇME KONULAR-Bahar Dönemi2+237
Ders Programı
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Diliİngilizce
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüPrograma Bağlı Seçmeli
Dersin KoordinatörüDr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK
Dersi VerenlerDr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK
Dersin Yardımcıları
Dersin AmacıThis course provides gradute level knowledge of bioinformatics by evaluation of selected topics in the field.
Dersin İçeriğiBu ders; Introduction to fundamental bioinformatics,Introduction to Linux,Primary bioinformatics data formats and databases,Scientific programming and bioinformatics workflows,Statistical İnference and data mining in bioinformatics,Sequence alignments and motif search methods,Phylogenetic tree construction and comparative genomics,Structural bioinformatics of proteins,Genome data analysis,Transcriptome data analysis,Proteome data analysis,Mıcrobiome data analysıs,Network analysis and Systems Biology,Lastest advancements and emerging topics in bioinformatics; konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme KazanımlarıÖğretim YöntemleriÖlçme Yöntemleri
Students will gain knowledge about main concepts and key methods in bioinformatics.16, 37, 6A, E, G
Students will be able to retrieve, organize and manage biological data. Students will learn to recognize computational challenges and describe bioinformatics problems. Students will be able to comprehend related methodology and apply proper bioinformatics solutions.3, 37, 5, 6A, E, G
Students will be able to evaluate and interpret the data analysis result. Students will learn to use appropriate terminology and report bioinformatics findings. 10, 12, 16, 37, 6A, E, G
Students will obtain novel insights into interdisciplinary and integrative research strategies.10, 16, 37, 6A, E, G
Students will be able to discuss recent developments and emerging topics in bioinformatics. Students being able to follow state-of-the-art research in this interdisciplinary field.10, 13, 14, 16, 6A, E, G
Öğretim Yöntemleri:10: Tartışma Yöntemi, 12: Problem Çözme Yöntemi, 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 3: Probleme Dayalı Öğrenme Modeli, 37: Bilgisayar Ve İnternet Destekli Öğretim, 5: İşbirlikli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli
Ölçme Yöntemleri:A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev, G: Kısa Sınav

Ders Akışı

SıraKonularÖn Hazırlık
1Introduction to fundamental bioinformatics
2Introduction to Linux
3Primary bioinformatics data formats and databases
4Scientific programming and bioinformatics workflows
5Statistical İnference and data mining in bioinformatics
6Sequence alignments and motif search methods
7Phylogenetic tree construction and comparative genomics
8Structural bioinformatics of proteins
9Genome data analysis
10Transcriptome data analysis
11Proteome data analysis
12Mıcrobiome data analysıs
13Network analysis and Systems Biology
14Lastest advancements and emerging topics in bioinformatics
Kaynak
Understanding bioinformatics. Published in 2008. Marketa Zvelebil & Jeremy O. Baum. ISBN-10: 0-8153-4024-9 (pbk.). Garland Science, Taylor & Francis Group, LLC.

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
NoProgram Yeterliliği Katkı Düzeyi
12345
1
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji ve diğer ilgili alanlarda bilimsel düzeyde araştırma yaparak bilgiye ulaşma, bilgiyi değerlendirme, yorumlama ve uygulama becerisi geliştirir.
X
2
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji ve bu alanla ilişkili değişik disiplinlere ait bilgileri birleştirebilme ve beraber değerlendirebilme becerisi geliştirir.
X
3
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarındaki sorunları tanımlayabilme, çözmek için yöntem geliştirme ve elde edilen bilgiyi uygulama becerisi geliştirir.
X
4
Temel biyoistatistik yöntemleri bilir, bilimsel deneysel çalışma sonuçlarına uygular ve istatistiksel olarak yorumlar.
X
5
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarında yeni ve gelişmekte olan uygulamaları bilme, gerektiğinde bunları etkili bir biçimde kullanma ve öğretme becerisi geliştirir.
X
6
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarında mevcut olan bilimsel bilgiye ulaşabilme, eleştirel olarak yorumlama ve kullanabilme becerisi geliştirir.
X
7
Yeni ve orijinal fikir ve yöntemler geliştirme becerisi edinir.
X
8
Teorik bilgisini, eleştirel düşünme yetisini kullanarak, bağımsız olarak özel çalışma alanına uygular, yaptığı çalışma sonuçlarını değerlendirir, yorumlar ve çalışmanın raporunu yazar.
X
9
Sağlık alanında çalışma yürüten bir ekip içinde liderlik yapma, karmaşık durumlarda çözüm sağlayabilecek yeni fikirler geliştirebilme ve sorumluluk alma becerisi geliştirir.
10
Çalışmaları sonucunda ulaştığı bilimsel bilgiyi ulusal ve uluslararası ortamlarda sistematik ve açık bir şekilde yazılı ya da sözlü olarak aktarabilme becerisi geliştirir.
11
Bir danışman yardımıyla ya da bireysel olarak bilimsel veya teknik bir sorunu tanımlar, çözümü ile ilgili öneriler getirebilir ve gerektiğinde çözer.
X
12
Eğitim, uygulama ve araştırma faaliyetlerinin tüm basamaklarında etik ve mesleki ilkelere uygun davranma becerisi geliştirir. Elde edilen sonuçları kalite kriterleri çerçevesinde değerlendirir.
13
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek denetleyebilir ve bu değerleri öğretebilir.

Değerlendirme Sistemi

Katkı DüzeyiMutlak Değerlendirme
Ara Sınavın Başarıya Oranı 50
Genel Sınavın Başarıya Oranı 50
Toplam 100
AKTS / İşyükü Tablosu
EtkinlikSayıSüresi (Saat)Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Saati000
Rehberli Problem Çözme000
Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi000
Okul Dışı Diğer Faaliyetler000
Proje Sunumu / Seminer000
Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı000
Ara Sınav ve Hazırlığı000
Genel Sınav ve Hazırlığı000
Performans Görevi, Bakım Planı000
Toplam İş Yükü (Saat)0
Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(0/30)0
Dersin AKTS Kredisi: *30 saatlik çalışma 1 AKTS kredisi sayılmaktadır.

Dersin Detaylı Bilgileri

Ders Tanımı

DersKoduYarıyılT+U SaatKrediAKTS
BİYOENFORMATİKTE SEÇME KONULAR-Bahar Dönemi2+237
Ders Programı
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Diliİngilizce
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüPrograma Bağlı Seçmeli
Dersin KoordinatörüDr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK
Dersi VerenlerDr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK
Dersin Yardımcıları
Dersin AmacıThis course provides gradute level knowledge of bioinformatics by evaluation of selected topics in the field.
Dersin İçeriğiBu ders; Introduction to fundamental bioinformatics,Introduction to Linux,Primary bioinformatics data formats and databases,Scientific programming and bioinformatics workflows,Statistical İnference and data mining in bioinformatics,Sequence alignments and motif search methods,Phylogenetic tree construction and comparative genomics,Structural bioinformatics of proteins,Genome data analysis,Transcriptome data analysis,Proteome data analysis,Mıcrobiome data analysıs,Network analysis and Systems Biology,Lastest advancements and emerging topics in bioinformatics; konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme KazanımlarıÖğretim YöntemleriÖlçme Yöntemleri
Students will gain knowledge about main concepts and key methods in bioinformatics.16, 37, 6A, E, G
Students will be able to retrieve, organize and manage biological data. Students will learn to recognize computational challenges and describe bioinformatics problems. Students will be able to comprehend related methodology and apply proper bioinformatics solutions.3, 37, 5, 6A, E, G
Students will be able to evaluate and interpret the data analysis result. Students will learn to use appropriate terminology and report bioinformatics findings. 10, 12, 16, 37, 6A, E, G
Students will obtain novel insights into interdisciplinary and integrative research strategies.10, 16, 37, 6A, E, G
Students will be able to discuss recent developments and emerging topics in bioinformatics. Students being able to follow state-of-the-art research in this interdisciplinary field.10, 13, 14, 16, 6A, E, G
Öğretim Yöntemleri:10: Tartışma Yöntemi, 12: Problem Çözme Yöntemi, 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 3: Probleme Dayalı Öğrenme Modeli, 37: Bilgisayar Ve İnternet Destekli Öğretim, 5: İşbirlikli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli
Ölçme Yöntemleri:A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev, G: Kısa Sınav

Ders Akışı

SıraKonularÖn Hazırlık
1Introduction to fundamental bioinformatics
2Introduction to Linux
3Primary bioinformatics data formats and databases
4Scientific programming and bioinformatics workflows
5Statistical İnference and data mining in bioinformatics
6Sequence alignments and motif search methods
7Phylogenetic tree construction and comparative genomics
8Structural bioinformatics of proteins
9Genome data analysis
10Transcriptome data analysis
11Proteome data analysis
12Mıcrobiome data analysıs
13Network analysis and Systems Biology
14Lastest advancements and emerging topics in bioinformatics
Kaynak
Understanding bioinformatics. Published in 2008. Marketa Zvelebil & Jeremy O. Baum. ISBN-10: 0-8153-4024-9 (pbk.). Garland Science, Taylor & Francis Group, LLC.

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
NoProgram Yeterliliği Katkı Düzeyi
12345
1
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji ve diğer ilgili alanlarda bilimsel düzeyde araştırma yaparak bilgiye ulaşma, bilgiyi değerlendirme, yorumlama ve uygulama becerisi geliştirir.
X
2
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji ve bu alanla ilişkili değişik disiplinlere ait bilgileri birleştirebilme ve beraber değerlendirebilme becerisi geliştirir.
X
3
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarındaki sorunları tanımlayabilme, çözmek için yöntem geliştirme ve elde edilen bilgiyi uygulama becerisi geliştirir.
X
4
Temel biyoistatistik yöntemleri bilir, bilimsel deneysel çalışma sonuçlarına uygular ve istatistiksel olarak yorumlar.
X
5
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarında yeni ve gelişmekte olan uygulamaları bilme, gerektiğinde bunları etkili bir biçimde kullanma ve öğretme becerisi geliştirir.
X
6
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanlarında mevcut olan bilimsel bilgiye ulaşabilme, eleştirel olarak yorumlama ve kullanabilme becerisi geliştirir.
X
7
Yeni ve orijinal fikir ve yöntemler geliştirme becerisi edinir.
X
8
Teorik bilgisini, eleştirel düşünme yetisini kullanarak, bağımsız olarak özel çalışma alanına uygular, yaptığı çalışma sonuçlarını değerlendirir, yorumlar ve çalışmanın raporunu yazar.
X
9
Sağlık alanında çalışma yürüten bir ekip içinde liderlik yapma, karmaşık durumlarda çözüm sağlayabilecek yeni fikirler geliştirebilme ve sorumluluk alma becerisi geliştirir.
10
Çalışmaları sonucunda ulaştığı bilimsel bilgiyi ulusal ve uluslararası ortamlarda sistematik ve açık bir şekilde yazılı ya da sözlü olarak aktarabilme becerisi geliştirir.
11
Bir danışman yardımıyla ya da bireysel olarak bilimsel veya teknik bir sorunu tanımlar, çözümü ile ilgili öneriler getirebilir ve gerektiğinde çözer.
X
12
Eğitim, uygulama ve araştırma faaliyetlerinin tüm basamaklarında etik ve mesleki ilkelere uygun davranma becerisi geliştirir. Elde edilen sonuçları kalite kriterleri çerçevesinde değerlendirir.
13
Moleküler Tıp ve Biyoteknoloji alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, uygulanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri gözeterek denetleyebilir ve bu değerleri öğretebilir.

Değerlendirme Sistemi

Katkı DüzeyiMutlak Değerlendirme
Ara Sınavın Başarıya Oranı 50
Genel Sınavın Başarıya Oranı 50
Toplam 100

Sayısal Veriler

Öğrenci Başarı Durumu

Ekleme Tarihi: 31/01/2023 - 15:16Son Güncelleme Tarihi: 31/01/2023 - 15:18