İstanbul Medipol Üniversitesi Kavacık Yerleşkesi Anadolu yakasında Beykoz ilçesi sınırları içerisindedir. Fatih Sultan Mehmet Köprüsünden önceki Kavacık Kavşağında yer almakta ve toplu taşıma araçları güzergâhında bulunmaktadır.

Medipol Üniversitesi'nin Beykoz Kavacık'ta, Güney ve Kuzey olmak üzere iki ayrı kampüsü bulunmaktadır. Kavacık Kampüsleri, Fatih Sultan Mehmet Köprüsü'nün Anadolu Yakası ayağının hemen çıkışında yer alır ve hem toplu taşıma hem de özel araçlarla kolaylıkla erişilebilir bir konumdadır.

Haliç Kampüsü; Suriçi’nde, Haliç’in kenarında yer almaktadır. Kentin en merkezi konumuna sahip olan Kampüs, çevresindeki tarihi ve kültürel zenginlik ile öne çıkmaktadır. Haliç Kampüsü; modern binası, ferah lobisi ve bahçeleri ile canlı bir üniversite yaşamına ev sahipliği yapmaktadır.

Öğrencilerin uygulama dersleri ve staj eğitimlerinin yapıldığı Bağcılar'daki Medipol Üniversitesi Hastanesi merkezi konumu ve dev bir eğitim kompleksi olması ile öne çıkmaktadır.