Ders Detayı
Ders Tanımı
| Ders | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ VE BİYOKİMYA | 4+0 | 4 | 10 |
| Ders Programı |
| Ön Koşul Dersleri | |
| Önerilen Seçmeli Dersler |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Programa Bağlı Seçmeli |
| Dersin Koordinatörü | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ |
| Dersi Verenler | Prof.Dr. Neslin EMEKLİ, Prof.Dr. Gürkan ÖZTÜRK, Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Doç.Dr. Sultan Sibel ERDEM, Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM, Dr.Öğr.Üye. Deniz DURALI, Dr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK, Prof.Dr. Türkan YİĞİTBAŞI, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER |
| Dersin Yardımcıları | |
| Dersin Amacı | Bu dersin amacı ökaryot hücrenin yapısını ve temel metabolik faaliyetlerini bütün halinde ve multidisipliner yaklaşımla anlaşılmasını sağlamaktır. |
| Dersin İçeriği | Bu ders; Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) ,Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi) ,Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz,Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan),Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) ,Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi),Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli),Karbonhidratlar (Prof. Dr. Nesrin Emekli),Yağlar (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı),Proteinler ve Nükleik Asitler (Dr. Öğr. Üyesi S. Sibel Erdem),Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı),İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı); konularını içermektedir. |
| Dersin İçeriği | Öğretim Yöntemleri | Ölçme Yöntemleri |
| 1-Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 1.1.Hücre mekaniğinin önemi, hücresel oluşumlar ve görevlerini açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 1.2.Hücre iskeleti oluşturan proteinler ve hücresel işlevlerini açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 1.3.Hücre iskeleti ile ilişkili motor proteinler ve görevlerini tanımlar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 1.4.Yapısal ve adesiv ekstraselülar matriks komponentlerinin yapı ve işlevlerinin örnekler ile açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2-Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2.1.Ökaryotk hücrelerde hücre döngüsünün evrelerini tanımlar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2.2.Hücre döngüsünün kontrol eden siklinler ve sikline bağlı kinazların moleküler mekanizmalarını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2.3.Mitoz ve mayoz bölünmenin evrelerini tanımlar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2.4.Kanserin moleküler mekanizmalarını ve metastaz safhalarını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 2.5.Kanser oluşum, ilerleme ve tedavsine yönelik temel prensipleri örnekler ile açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3- Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz, Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3.1.Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmalarını açıklar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3.2.Apoptozun mekanzması, apoptozda etkili organel, enzimler ve apoptozun moleküler basamaklarını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3.3.Nekrotik ölümü tanımlar ve apoptotik ölüm ile karşılaştırır. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3.4.Otofajinin mekanizması ve ilişkili olduğu hastalıkları örnekler ile açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 3.5.Hücre yaşlanmasında etkili hücre içi ve dışı mekanizma ve faktörleri tanımlar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 4-Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 4.1.Sinyal iletiminin moleküler prensiplerini açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 4.2.G-proteinine bağlı reseptörler (GPCR) aracılı sinyal iletiminin mekanizmasını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 4.3.Reseptör tirozin kinaz (RTK) aracılı sinyal iletiminin mekanizmasını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 5-Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 5.1.Hücre yenilenmesinde rolü olan hücre içi ve dışı etkenleri tanımlar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 5.2.Kök hücreyi embriyonik ve erişkin kökene göre tanımlar ve örnekler ile açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 5.3.Uyarılmış pluripotent kök hücre üretimi ve karakterizasyonu ile laboratuvardaki kullanım alanlarını açıklar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 5.4.Doku mühendisliği ve onarımında kök hücre uygulamalarını yorumlar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6- Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6.1.Diyetle alınan besinlerin enterositlere girişini bilir. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6.2.Enterositlerde yeniden sentez yapıldığını kavrar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6.3.Ekzojen ve endojen moleküllerden enerji üretimini kavrar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6.4.Metabolitlerin detoksifikasyonu(üre sentezi, H2O2 v.b) hakkında bilgi sahibidir. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 6.5.Çeşitli reaksiyonlarda görev alacak moleküllerin sentezi, yıkılması ve metabolizmadaki rollerini özetler. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 7- Karbonhidratlar (Prof.Dr.Nesrin Emekli) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 7.1.Karbonhidratların metabolik yolunu sorgulayabilir | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 7.2.Kana geçen glukozun akıbetini ve glisemik kontrolü tartışır | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 7.3.Glikozdan enerji üretim yollarını özümler | 1, 2, 3, 4, 5, 9 | A, B, C |
| 7.4.Glukozun diğer moleküllere ve diğer moleküllerin glukoza dönüşüm yollarını bilir | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 7.5.Enerji metabolizmasında karbonhidratların önemini kavrar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8- Yağlar (Prof.Dr.Türkan Yiğitbaşı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.1.Lipitlerin yapısını ve özelliklerini tanımlar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.2.Yağ asidlerinin özelliklerini ve önemini kavrar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.3.Esansiyel yağ asitlerini ve kardiyak hastalıklardaki rolünü sorgular. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.4.Lipoproteinlerin önemini tartışır | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.5.Apoproteinlerin lipit metabolizmasındaki önemini tartışır | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.6.Yağ asidleri ile esterleşen alkolleri kavrar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.7.Lipit metabolizma bozukluklarının ve lipidlerin ateroskleroz gelişimindeki önemini sorgular | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 8.8.Enerji metabolizmasında lipidlerin önemini kavrar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 9- Proteinler ve Nükleik Asitler (Y.Doç.Dr.Sibel Erdem) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 9.1.Nükleik Asitlerin yapısını ve özelliklerini tanımlar | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 9.2.Pürin, pürimidin bazlarının denova sentezini ve sentezin inhibisyonu ile etki eden ilaç metabolizmaları kavrar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 9.3.Pürin, pürimidin sentez basamaklarını, basamaklardaki aktivasyon ve inhibisyonlarını kavrar. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 9.4.Pürin, pürimidin bazlarının yıkımını ve ilişkili patolojileri özetler. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 10-Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 10.1.Kanser hücre enerji metabolizmasının, normal hücreden farklı olduğu bilir | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 10.2.Warburg etkisini tartışır. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 10.3.Kanser hücresinin glukozu fazla kullanmasındaki mekanizmaları sorgular. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 10.4.Kanser hücresinin metabolizmasında Hipoksi ile indüklenebilir faktör–1 alfa (HIF–1α)’ın rolünü bilir. | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 11-İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 12-Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 13-Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| 14-Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | 1, 10, 2, 3, 4, 5 | A, B, C |
| Öğretim Yöntemleri: | 1: Anlatım, 10: Beyin Fırtınası, 2: Soru - Cevap, 3: Tartışma, 4: Alıştırma ve Uygulama, 5: Gösteri, 9: Benzetim |
| Ölçme Yöntemleri: | A: Yazılı sınav, B: Sözlü Sınav, C: Ödev |
Ders Akışı
| Sıra | Konular | Ön Hazırlık |
| 1 | Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) | |
| 2 | Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi) | 4 numaralı kaynak |
| 3 | Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz,Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan) | |
| 4 | Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) | |
| 5 | Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi) | 4 numaralı kaynak |
| 6 | Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli) | 1,2,3 numaralı kaynaklar |
| 7 | Karbonhidratlar (Prof. Dr. Nesrin Emekli) | 1,2,3 numaralı kaynaklar |
| 8 | Yağlar (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı) | 1,2,3 numaralı kaynaklar |
| 9 | Proteinler ve Nükleik Asitler (Dr. Öğr. Üyesi S. Sibel Erdem) | 1,2,3 numaralı kaynaklar |
| 10 | Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı) | 1,2,3 numaralı kaynaklar |
| 11 | İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | |
| 12 | Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | |
| 13 | Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) | |
| 14 | Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) |
| Kaynak |
| 1.Yiğitbaşı T, Emekli N. Biyokimya Laboratuarı. İstanbul Medipol Üniversitesi, Yayınları, Akademi Basın Yayın, İstanbul 2013. 2.Emekli N. Temel ve Uygulamalı Biyokimya, 4.Baskı. Akademi Basın Yayın, İstanbul 2006. 3.Marks Basic Medical Biochemistry A Clinical Approach.Lieberman M,Marks,AD. Lippiccott Williams Wilkins. 4.Güneş HV, Moleküler Hücre Biyolojisi, 5. Baskı, İstanbul Tıp Kitabevi, 2018. |
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
| Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı | |||||||
| No | Program Yeterliliği | Katkı Düzeyi | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 0 | - Hücre yapı-fonksiyon ilişkisini açıklar. | ||||||
| 0 | Hücrenin organellerinin fonksiyonları ve organel yapı-işlev bozuklukları ile ilişkili hastalıkları tanımlar. | ||||||
| 0 | Tıbbi Biyoloji ve Tıbbi genetik laboratuvarlarında kullanılan temel ve ileri düzey gereç ve cihazları tanımlar, kullanım amaçlarını açıklar. | ||||||
| 0 | Laboratuvarda uyulması gereken kuralları ve güvenlik konularını açıklar ve düzenleyebilir. | ||||||
| 0 | İstatistiksel yöntemlere hakimdir. | ||||||
| 0 | Alanındaki yeni bilgileri sistematik bir yaklaşımla değerlendirir, kullanır ve geliştirir. | ||||||
| 0 | Bilimsel literatürü yabancı dil etkinliği yüksek düzeyde takip eder, gerekli bilgisayar ve teknik donanımlarını geliştirir ve aktif uygular. | ||||||
| 0 | Alanının ilişkili olduğu disiplinler arası etkileşimi kavrar; yeni ve karmaşık fikirleri analiz, sentez ve değerlendirmede uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak özgün sonuçlara ulaşır. | ||||||
| 0 | Klinik ya da klinik olmayan çalışmalara katılabilir, metod önerilerinde bulunabilir. | ||||||
| 0 | Bilimsel proje oluşturabilir. | ||||||
| 0 | Bilimsel araştırma sonuçlarını makale haline getirebilir. | ||||||
| 0 | Bilimsel verilerin analizi yapabilir ve yorumlayabilir. | ||||||
| 0 | Özgün bir çalışmayı bağımsız olarak gerçekleştirerek alanındaki ilerlemeye katkıda bulunur. | ||||||
| 0 | Kendi başına öğrenme yöntemlerini geliştirerek, faaliyet gösterdiği bilim alanında hayat boyu öğrenmeyi uygular. | ||||||
| 0 | Alanında çalışma yürüten bir ekip içinde liderlik yapma, karmaşık durumlarda çözüm sağlayabilecek yeni fikirler geliştirebilme ve sorumluluk alma becerisi geliştirir. | ||||||
| 0 | - Alanı ile ilgili ve bilimsel araştırma konularında başkaları ile iletişim kurarak, bilgi ve fikir alışverişi yapabilir. | ||||||
| 0 | Alanı ile ilgili sahip olduğu temel bilgi birikimini kullanarak verilen bir görevi bağımsız olarak yürütür. | ||||||
| 0 | Alanında edindiği temel düzeydeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirir; öğrenme gereksinimlerini belirler ve öğrenmesini yönlendirir. | ||||||
| 0 | Birey olarak görev, hak ve sorumlulukları ile ilgili yasa, yönetmelik, mevzuat ve mesleki etik kurallarına uygun davranır. | ||||||
| 0 | Bilimsel bilgiyi, ulusal veya uluslararası bilimsel toplantılarda yazılı veya sözlü olarak aktarabilir, işbirlikleri kurar. | ||||||
Değerlendirme Sistemi
| Katkı Düzeyi | Mutlak Değerlendirme | |
| Ara Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Genel Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Toplam | 100 | |