Ana içeriğe atla

Ders Tanımı

DersKoduYarıyılT+U SaatKrediAKTS
MOLEKÜLER HÜCRE BİYOLOJİSİ VE BİYOKİMYA4+0410
Ders Programı
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiDoktora
Dersin TürüPrograma Bağlı Seçmeli
Dersin KoordinatörüProf.Dr. Esra ÇAĞAVİ
Dersi VerenlerProf.Dr. Neslin EMEKLİ, Prof.Dr. Gürkan ÖZTÜRK, Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Doç.Dr. Sultan Sibel ERDEM, Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM, Dr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK, Dr.Öğr.Üye. Deniz DURALI, Prof.Dr. Türkan YİĞİTBAŞI, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER
Dersin Yardımcıları
Dersin AmacıBu dersin amacı ökaryot hücrenin yapısını ve temel metabolik faaliyetlerini bütün halinde ve multidisipliner yaklaşımla anlaşılmasını sağlamaktır.
Dersin İçeriğiBu ders; Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) ,Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi)
,Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz,Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan),Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) ,Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi),Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli),Karbonhidratlar (Prof. Dr. Nesrin Emekli),Yağlar (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı),Proteinler ve Nükleik Asitler (Dr. Öğr. Üyesi S. Sibel Erdem),Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı),İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı),Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı); konularını içermektedir.
Dersin İçeriğiÖğretim YöntemleriÖlçme Yöntemleri
1-Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
1.1.Hücre mekaniğinin önemi, hücresel oluşumlar ve görevlerini açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
1.2.Hücre iskeleti oluşturan proteinler ve hücresel işlevlerini açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
1.3.Hücre iskeleti ile ilişkili motor proteinler ve görevlerini tanımlar.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
1.4.Yapısal ve adesiv ekstraselülar matriks komponentlerinin yapı ve işlevlerinin örnekler ile açıklar.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2-Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi)1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2.1.Ökaryotk hücrelerde hücre döngüsünün evrelerini tanımlar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2.2.Hücre döngüsünün kontrol eden siklinler ve sikline bağlı kinazların moleküler mekanizmalarını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2.3.Mitoz ve mayoz bölünmenin evrelerini tanımlar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2.4.Kanserin moleküler mekanizmalarını ve metastaz safhalarını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
2.5.Kanser oluşum, ilerleme ve tedavsine yönelik temel prensipleri örnekler ile açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3- Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz, Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3.1.Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmalarını açıklar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3.2.Apoptozun mekanzması, apoptozda etkili organel, enzimler ve apoptozun moleküler basamaklarını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3.3.Nekrotik ölümü tanımlar ve apoptotik ölüm ile karşılaştırır. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3.4.Otofajinin mekanizması ve ilişkili olduğu hastalıkları örnekler ile açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
3.5.Hücre yaşlanmasında etkili hücre içi ve dışı mekanizma ve faktörleri tanımlar.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
4-Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
4.1.Sinyal iletiminin moleküler prensiplerini açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
4.2.G-proteinine bağlı reseptörler (GPCR) aracılı sinyal iletiminin mekanizmasını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
4.3.Reseptör tirozin kinaz (RTK) aracılı sinyal iletiminin mekanizmasını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
5-Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
5.1.Hücre yenilenmesinde rolü olan hücre içi ve dışı etkenleri tanımlar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
5.2.Kök hücreyi embriyonik ve erişkin kökene göre tanımlar ve örnekler ile açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
5.3.Uyarılmış pluripotent kök hücre üretimi ve karakterizasyonu ile laboratuvardaki kullanım alanlarını açıklar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
5.4.Doku mühendisliği ve onarımında kök hücre uygulamalarını yorumlar.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6- Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6.1.Diyetle alınan besinlerin enterositlere girişini bilir. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6.2.Enterositlerde yeniden sentez yapıldığını kavrar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6.3.Ekzojen ve endojen moleküllerden enerji üretimini kavrar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6.4.Metabolitlerin detoksifikasyonu(üre sentezi, H2O2 v.b) hakkında bilgi sahibidir. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
6.5.Çeşitli reaksiyonlarda görev alacak moleküllerin sentezi, yıkılması ve metabolizmadaki rollerini özetler. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
7- Karbonhidratlar (Prof.Dr.Nesrin Emekli) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
7.1.Karbonhidratların metabolik yolunu sorgulayabilir 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
7.2.Kana geçen glukozun akıbetini ve glisemik kontrolü tartışır 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
7.3.Glikozdan enerji üretim yollarını özümler 1, 2, 3, 4, 5, 9A, B, C
7.4.Glukozun diğer moleküllere ve diğer moleküllerin glukoza dönüşüm yollarını bilir 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
7.5.Enerji metabolizmasında karbonhidratların önemini kavrar1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8- Yağlar (Prof.Dr.Türkan Yiğitbaşı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.1.Lipitlerin yapısını ve özelliklerini tanımlar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.2.Yağ asidlerinin özelliklerini ve önemini kavrar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.3.Esansiyel yağ asitlerini ve kardiyak hastalıklardaki rolünü sorgular. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.4.Lipoproteinlerin önemini tartışır 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.5.Apoproteinlerin lipit metabolizmasındaki önemini tartışır 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.6.Yağ asidleri ile esterleşen alkolleri kavrar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.7.Lipit metabolizma bozukluklarının ve lipidlerin ateroskleroz gelişimindeki önemini sorgular 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
8.8.Enerji metabolizmasında lipidlerin önemini kavrar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
9- Proteinler ve Nükleik Asitler (Y.Doç.Dr.Sibel Erdem) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
9.1.Nükleik Asitlerin yapısını ve özelliklerini tanımlar 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
9.2.Pürin, pürimidin bazlarının denova sentezini ve sentezin inhibisyonu ile etki eden ilaç metabolizmaları kavrar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
9.3.Pürin, pürimidin sentez basamaklarını, basamaklardaki aktivasyon ve inhibisyonlarını kavrar. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
9.4.Pürin, pürimidin bazlarının yıkımını ve ilişkili patolojileri özetler.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
10-Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
10.1.Kanser hücre enerji metabolizmasının, normal hücreden farklı olduğu bilir 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
10.2.Warburg etkisini tartışır.1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
10.3.Kanser hücresinin glukozu fazla kullanmasındaki mekanizmaları sorgular. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
10.4.Kanser hücresinin metabolizmasında Hipoksi ile indüklenebilir faktör–1 alfa (HIF–1α)’ın rolünü bilir. 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
11-İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
12-Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
13-Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
14-Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı) 1, 10, 2, 3, 4, 5A, B, C
Öğretim Yöntemleri:1: Anlatım, 10: Beyin Fırtınası, 2: Soru - Cevap, 3: Tartışma, 4: Alıştırma ve Uygulama, 5: Gösteri, 9: Benzetim
Ölçme Yöntemleri:A: Yazılı sınav, B: Sözlü Sınav, C: Ödev

Ders Akışı

SıraKonularÖn Hazırlık
1Hücre Mekaniği, Hücre İskeleti ve Motor Proteinler, ECM ile Etkileşim (Prof. Dr. Gürkan Öztürk)
2Hücre Döngüsü, Mitoz, Mayoz Bölünme ve Kanser (Doç. Dr. Esra Çağavi)
4 numaralı kaynak
3Hücre sağkalım ve ölüm mekanizmaları, Apoptoz, Nekroz,Otofaji ve Yaşlanma (Dr. Öğr. Üyesi Turan Demircan)
4Sinyal iletim mekanizmaları (Prof. Dr. Gürkan Öztürk)
5Hücre Yenilenme ve Farklılaşması, Kök Hücre ve Doku Onarımı (Doç. Dr. Esra Çağavi)4 numaralı kaynak
6Hücre Biyokimyası (Prof. Dr. Nesrin Emekli)1,2,3 numaralı kaynaklar
7Karbonhidratlar (Prof. Dr. Nesrin Emekli)1,2,3 numaralı kaynaklar
8Yağlar (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı)1,2,3 numaralı kaynaklar
9Proteinler ve Nükleik Asitler (Dr. Öğr. Üyesi S. Sibel Erdem)1,2,3 numaralı kaynaklar
10Hücre Enerji Metabolizması, Mitokondri, Kanser ve Açlık (Prof. Dr. Türkan Yiğitbaşı)1,2,3 numaralı kaynaklar
11İnsan Mikrobiyomu ve Taksonomi, Mikrorganizmaların Tanımlanması, İmmün Organlar (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı)
12Doğal Bağışıklık ve Komponentleri, İmmün Yanıtın Fazları, (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı)
13Edinsel Bağışıklık ve Komponentleri (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı)
14Kompleman Sistem, Otoimmünite ve Virüsler (Prof. Dr. Süleyman Yıldırım, Dr. Öğr. Üyesi Deniz Duralı)
Kaynak
1.Yiğitbaşı T, Emekli N. Biyokimya Laboratuarı. İstanbul Medipol Üniversitesi, Yayınları, Akademi Basın Yayın, İstanbul 2013. 2.Emekli N. Temel ve Uygulamalı Biyokimya, 4.Baskı. Akademi Basın Yayın, İstanbul 2006. 3.Marks Basic Medical Biochemistry A Clinical Approach.Lieberman M,Marks,AD. Lippiccott Williams Wilkins. 4.Güneş HV, Moleküler Hücre Biyolojisi, 5. Baskı, İstanbul Tıp Kitabevi, 2018.

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı

Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
NoProgram Yeterliliği Katkı Düzeyi
12345
0
Organ ve sistemlerin temel fonksiyonlarını ve çalışma mekanizmalarını bilir ve her bir sistemi ders konusu olarak anlatabilir
0
Tek başına kadavraların farklı bölgelerine disseksiyon yapabilir, üzerinde organları ve diğer yapıları tanımlayabilir, üzerinde ders anlatabilir
0
Bireysel olarak bir konu üzerine proje tasarlayabilir, o projede aktif olarak yer alabilir, bilimsel araştırma sonuçlarını makale haline getirebilir, yayın yapabilir.
0
Alanı ile ilgili multidisipliner çalışmalarda aktif olarak rol alabilir.
0
Radyogram, MR ve CT görüntülerindeki normal anatomik yapıları tanımlayabilir ve patolojik durumlara anatomik açıklama getirebilir
0
Anatomi disiplininin diğer temel tıp ve klinik dallar ile ilişkisini kavrar ve bu ilişki çerçevesinde ortak çalışmalar yürütür.
0
En az bir yabancı dili etkin olarak kullanarak kendi alanında ve çalışma konusunu ilgilendiren diğer alanlarda uluslararası yayınları takip edebilir.
0
Organların ve yapıların topografik düzenlemesini, yüzey projeksiyonlarını ve seyirlerini bilir
0
Kendi alanındaki konuların ve değerlendirdiği bilimsel verileri ve diğer araştırmacıların bilimsel verilerini sunu halinde aktarabilir.
0
Güncel araştırma konularını takip ederek, yeni verileri analiz eder.
0
Multidisipliner çalışmalarda takım içerisinde verilen sorumluluğu etkin olarak yerine getirir.
0
Klinik problemleri sentezleyebilir ve ona anatomik bir açıklama yapabilir.
0
İnsan vücudundaki, doku, organ ve sistemlerdeki temel mikroanatomik yapıları tanımlayabilir.
0
Öğrencilerle güven temelli ilişki kurabilir ve derse ilgilerini teşvik edebilir.

Değerlendirme Sistemi

Katkı DüzeyiMutlak Değerlendirme
Ara Sınavın Başarıya Oranı 50
Genel Sınavın Başarıya Oranı 50
Toplam 100

Ders

-

Dersin Detaylı Bilgileri

-

Sayısal Veriler

Öğrenci Başarı Durumu