Course Detail
Course Detail
Course Description
| Course | Code | Semester | T+P (Hour) | Credit | ECTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BİOMEDİKAL OPTİK | EEE4210773 | Bahar Dönemi | 3+0 | 3 | 6 |
| Course Program | Çarşamba 13:30-14:15 Çarşamba 14:30-15:15 Çarşamba 15:30-16:15 |
| Prerequisites Courses | |
| Recommended Elective Courses |
| Language of Course | İngilizce |
| Course Level | Lisans |
| Course Type | Programa Bağlı Seçmeli |
| Course Coordinator | Doç.Dr. Muhammed Fatih TOY |
| Name of Lecturer(s) | Doç.Dr. Muhammed Fatih TOY |
| Assistant(s) | |
| Aim | Bu dersin amacı biyoloji ve medikal bilimler alanındaki problemlere optik yöntemler ile yeni çözümler geliştirmek ve mevcut çözümleri değerlendirmektir. |
| Course Content | Bu ders; Optiğin temel prensiplerine genel bakış,Işık kaynakları ve dedektörler,Doğrusal ve doğrusal olmayan spektroskopi,Bulanık ortamda ışık ilerlemesi,Işık ile hücre ve doku etkileşimi,Optik mikroskop yöntemleri,Optik eşfaz tomografisi,Difüze optik tomografi,Fotoakustik tomografi,Optik biyosensörler,Genomik ve proteomik uygulamaları için mikrodizinler,Akı sitometrisi,Lazer cımbızları,Fotodinamik terapi; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Teaching Methods | Assessment Methods |
| Biyomedikal parametreleri takip edebilmek için optik kavramları uygular | 6, 9 | A, F |
| Bulanık ortamda ışık ilerlemesini analiz eder | 2, 9 | A, F |
| Çeşitli biyomedikal optik teknik ve sistemleri anlayıp açıklar | 2, 6, 9 | A, F |
| Uygulamaya özel mikroskop sistemleri tasarlar | 6, 9 | A, F |
| Çeşitli optik yöntemlerin biyomedikal uygulamalardaki performansını değerlendirir | 6, 9 | A, F |
| Teaching Methods: | 2: Proje Temelli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli, 9: Anlatım Yöntemi |
| Assessment Methods: | A: Klasik Yazılı Sınav, F: Proje Görevi |
Course Outline
| Order | Subjects | Preliminary Work |
|---|---|---|
| 1 | Optiğin temel prensiplerine genel bakış | |
| 2 | Işık kaynakları ve dedektörler | |
| 3 | Doğrusal ve doğrusal olmayan spektroskopi | |
| 4 | Bulanık ortamda ışık ilerlemesi | |
| 5 | Işık ile hücre ve doku etkileşimi | |
| 6 | Optik mikroskop yöntemleri | |
| 7 | Optik eşfaz tomografisi | |
| 8 | Difüze optik tomografi | |
| 9 | Fotoakustik tomografi | |
| 10 | Optik biyosensörler | |
| 11 | Genomik ve proteomik uygulamaları için mikrodizinler | |
| 12 | Akı sitometrisi | |
| 13 | Lazer cımbızları | |
| 14 | Fotodinamik terapi |
| Resources |
| Introduction to Biophotonics, by Paras N. Prasad (John Wiley & Sons, Inc., 2003).Biomedical Optics: Principles and Imaging by Lihong V. Wang and Hsin-i Wu, (John Wiley & Sons, Inc., 2007). |
Course Contribution to Program Qualifications
| Course Contribution to Program Qualifications | |||||||
| No | Program Qualification | Contribution Level | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | Matematik, fen bilimleri ve ilgili mühendislik disiplinine özgü konularda yeterli bilgi birikimi; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanabilme becerisi | X | |||||
| 2 | Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi; bu amaçla uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi | X | |||||
| 3 | Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi | X | |||||
| 4 | Mühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi | X | |||||
| 5 | Karmaşık mühendislik problemlerinin veya disipline özgü araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi | X | |||||
| 6 | Disiplin içi ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışabilme becerisi; bireysel çalışma becerisi | ||||||
| 7 | Sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi; en az bir yabancı dil bilgisi; etkin rapor yazma ve yazılı raporları anlama, tasarım ve üretim raporları hazırlayabilme, etkin sunum yapabilme, açık ve anlaşılır talimat verme ve alma becerisi | ||||||
| 8 | Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci; bilgiye erişebilme, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi | ||||||
| 9 | Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilinci; mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi | ||||||
| 10 | Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi; girişimcilik, yenilikçilik hakkında farkındalık; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi | ||||||
| 11 | Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık | ||||||
Assessment Methods
| Contribution Level | Absolute Evaluation | |
| Rate of Midterm Exam to Success | 30 | |
| Rate of Final Exam to Success | 70 | |
| Total | 100 | |
| ECTS / Workload Table | ||||||
| Activities | Number of | Duration(Hour) | Total Workload(Hour) | |||
| Ders Saati | 14 | 3 | 42 | |||
| Rehberli Problem Çözme | 0 | 0 | 0 | |||
| Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi | 4 | 15 | 60 | |||
| Okul Dışı Diğer Faaliyetler | 0 | 0 | 0 | |||
| Proje Sunumu / Seminer | 4 | 1 | 4 | |||
| Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 | |||
| Ara Sınav ve Hazırlığı | 1 | 25 | 25 | |||
| Genel Sınav ve Hazırlığı | 1 | 35 | 35 | |||
| Performans Görevi, Bakım Planı | 0 | 0 | 0 | |||
| Total Workload(Hour) | 166 | |||||
| Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(166/30) | 6 | |||||
| ECTS of the course: 30 hours of work is counted as 1 ECTS credit. | ||||||
Detail Informations of the Course
Course Description
| Course | Code | Semester | T+P (Hour) | Credit | ECTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BİOMEDİKAL OPTİK | EEE4210773 | Bahar Dönemi | 3+0 | 3 | 6 |
| Course Program | Çarşamba 13:30-14:15 Çarşamba 14:30-15:15 Çarşamba 15:30-16:15 |
| Prerequisites Courses | |
| Recommended Elective Courses |
| Language of Course | İngilizce |
| Course Level | Lisans |
| Course Type | Programa Bağlı Seçmeli |
| Course Coordinator | Doç.Dr. Muhammed Fatih TOY |
| Name of Lecturer(s) | Doç.Dr. Muhammed Fatih TOY |
| Assistant(s) | |
| Aim | Bu dersin amacı biyoloji ve medikal bilimler alanındaki problemlere optik yöntemler ile yeni çözümler geliştirmek ve mevcut çözümleri değerlendirmektir. |
| Course Content | Bu ders; Optiğin temel prensiplerine genel bakış,Işık kaynakları ve dedektörler,Doğrusal ve doğrusal olmayan spektroskopi,Bulanık ortamda ışık ilerlemesi,Işık ile hücre ve doku etkileşimi,Optik mikroskop yöntemleri,Optik eşfaz tomografisi,Difüze optik tomografi,Fotoakustik tomografi,Optik biyosensörler,Genomik ve proteomik uygulamaları için mikrodizinler,Akı sitometrisi,Lazer cımbızları,Fotodinamik terapi; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Teaching Methods | Assessment Methods |
| Biyomedikal parametreleri takip edebilmek için optik kavramları uygular | 6, 9 | A, F |
| Bulanık ortamda ışık ilerlemesini analiz eder | 2, 9 | A, F |
| Çeşitli biyomedikal optik teknik ve sistemleri anlayıp açıklar | 2, 6, 9 | A, F |
| Uygulamaya özel mikroskop sistemleri tasarlar | 6, 9 | A, F |
| Çeşitli optik yöntemlerin biyomedikal uygulamalardaki performansını değerlendirir | 6, 9 | A, F |
| Teaching Methods: | 2: Proje Temelli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli, 9: Anlatım Yöntemi |
| Assessment Methods: | A: Klasik Yazılı Sınav, F: Proje Görevi |
Course Outline
| Order | Subjects | Preliminary Work |
|---|---|---|
| 1 | Optiğin temel prensiplerine genel bakış | |
| 2 | Işık kaynakları ve dedektörler | |
| 3 | Doğrusal ve doğrusal olmayan spektroskopi | |
| 4 | Bulanık ortamda ışık ilerlemesi | |
| 5 | Işık ile hücre ve doku etkileşimi | |
| 6 | Optik mikroskop yöntemleri | |
| 7 | Optik eşfaz tomografisi | |
| 8 | Difüze optik tomografi | |
| 9 | Fotoakustik tomografi | |
| 10 | Optik biyosensörler | |
| 11 | Genomik ve proteomik uygulamaları için mikrodizinler | |
| 12 | Akı sitometrisi | |
| 13 | Lazer cımbızları | |
| 14 | Fotodinamik terapi |
| Resources |
| Introduction to Biophotonics, by Paras N. Prasad (John Wiley & Sons, Inc., 2003).Biomedical Optics: Principles and Imaging by Lihong V. Wang and Hsin-i Wu, (John Wiley & Sons, Inc., 2007). |
Course Contribution to Program Qualifications
| Course Contribution to Program Qualifications | |||||||
| No | Program Qualification | Contribution Level | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | Matematik, fen bilimleri ve ilgili mühendislik disiplinine özgü konularda yeterli bilgi birikimi; bu alanlardaki kuramsal ve uygulamalı bilgileri, karmaşık mühendislik problemlerinde kullanabilme becerisi | X | |||||
| 2 | Karmaşık mühendislik problemlerini saptama, tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi; bu amaçla uygun analiz ve modelleme yöntemlerini seçme ve uygulama becerisi | X | |||||
| 3 | Karmaşık bir sistemi, süreci, cihazı veya ürünü gerçekçi kısıtlar ve koşullar altında, belirli gereksinimleri karşılayacak şekilde tasarlama becerisi; bu amaçla modern tasarım yöntemlerini uygulama becerisi | X | |||||
| 4 | Mühendislik uygulamalarında karşılaşılan karmaşık problemlerin analizi ve çözümü için gerekli olan modern teknik ve araçları geliştirme, seçme ve kullanma becerisi; bilişim teknolojilerini etkin bir şekilde kullanma becerisi | X | |||||
| 5 | Karmaşık mühendislik problemlerinin veya disipline özgü araştırma konularının incelenmesi için deney tasarlama, deney yapma, veri toplama, sonuçları analiz etme ve yorumlama becerisi | X | |||||
| 6 | Disiplin içi ve çok disiplinli takımlarda etkin biçimde çalışabilme becerisi; bireysel çalışma becerisi | ||||||
| 7 | Sözlü ve yazılı etkin iletişim kurma becerisi; en az bir yabancı dil bilgisi; etkin rapor yazma ve yazılı raporları anlama, tasarım ve üretim raporları hazırlayabilme, etkin sunum yapabilme, açık ve anlaşılır talimat verme ve alma becerisi | ||||||
| 8 | Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci; bilgiye erişebilme, bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleme ve kendini sürekli yenileme becerisi | ||||||
| 9 | Etik ilkelerine uygun davranma, mesleki ve etik sorumluluk bilinci; mühendislik uygulamalarında kullanılan standartlar hakkında bilgi | ||||||
| 10 | Proje yönetimi, risk yönetimi ve değişiklik yönetimi gibi, iş hayatındaki uygulamalar hakkında bilgi; girişimcilik, yenilikçilik hakkında farkındalık; sürdürülebilir kalkınma hakkında bilgi | ||||||
| 11 | Mühendislik uygulamalarının evrensel ve toplumsal boyutlarda sağlık, çevre ve güvenlik üzerindeki etkileri ve çağın mühendislik alanına yansıyan sorunları hakkında bilgi; mühendislik çözümlerinin hukuksal sonuçları konusunda farkındalık | ||||||
Assessment Methods
| Contribution Level | Absolute Evaluation | |
| Rate of Midterm Exam to Success | 30 | |
| Rate of Final Exam to Success | 70 | |
| Total | 100 | |