İnsan Mikrobiyomu dersinin amacı insan mikrobiyomunun bileşimi, işlevsel önemi ve insan sağlığı ve hastalığı ile olan karmaşık ilişkisini kapsayan kapsamlı bir anlayış sağlamaktır.
Course Content
Bu ders; Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları,Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi,Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti,Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler,Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü); konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Teaching Methods
Assessment Methods
1. Bileşimi, çeşitliliği ve mikrobiyal topluluklar ile insan konakçı arasındaki dinamik etkileşimlerini açıklar
2. Mikrobiyal toplulukları taksonomik ve işlevsel düzeyde analiz etmek için metagenomik ve metatranskriptomik gibi teknikleri kullanarak mikrobiyom verilerinin değerlendirilmesi ve yorumlanmasında ileri analitik beceriler geliştirir
3. Mikrobiyomun bulaşıcı hastalıklardan kronik durumlara kadar insan hastalıklarındaki rolünü keşfetmek ve mikrobiyal toplulukların sağlığı etkileme ve hastalık durumlarına katkıda bulunma mekanizmalarını açıklar
4. Karmaşık mikrobiyal ekosistemleri incelemek için çoklu omik verileri entegre etme konusunda yetkinlik kazanmak ve mikrobiyomun işlevsel yönlerini çözmede omik yaklaşımlarını açıklar
Teaching Methods:
Assessment Methods:
Course Outline
Order
Subjects
Preliminary Work
1
Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları
2
Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi
3
Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti
4
Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler
5
Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü)
Resources
1. Bioinformatic and Statistical Analysis of Microbiome Data: From Raw Sequences to Advanced Modeling with Qiime 2 and R,
2. Human-Gut Microbiome, Gunjan Goel, Teresa Requena, Saurabh Bansal ( ISBN: 9780323913133)
3. Bilimsel makaleler
Course Contribution to Program Qualifications
Course Contribution to Program Qualifications
No
Program Qualification
Contribution Level
1
2
3
4
5
1
Bilimsel araştırmaların planlanması ve istatistiksel değerlendirmesini yapar, sonuçlarını hakemli bir dergide yayinlamak uzere makale hazirlar ve/veya bilimsel bir toplantıda sunar.
2
Tıbbi Mikrobiyoloji alanında kullanılan laboratuvar yöntemlerini bilir ve mikroorganizmalarla ilgili deneysel calisma tasarimi yapar.
3
Mikrobiyoloji alanında yüksek düzeyde güncel bilimsel bilgi ve beceri kazanır ve alanındaki yenilikleri takip eder.
X
4
Uygulamalı temel mikrobiyoloji laboratuvarında rutin ve araştırma amacına hizmet eden cihaz ve aletlerin kullanımını bilir
5
Bilimsel çalışma sonuçlarını uzmanlik düzeyinde istatistiksel analizlerini yapma, degerlendirme, savunma ve yazili ya da sozlu sunma yetenekleri geliştirir.
X
6
Bilimsel proje yazma yetkinligi gelistirir.
7
Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer.
X
8
Tıbbi Mikrobiyoloji alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, seminerler verir
9
Mikrobiyal hastalıkları ve etiyolojisini uzmanlık düzeyinde anlar ve yorumlar.
X
Assessment Methods
Contribution Level
Absolute Evaluation
Rate of Midterm Exam to Success
50
Rate of Final Exam to Success
50
Total
100
ECTS / Workload Table
Activities
Number of
Duration(Hour)
Total Workload(Hour)
Ders Saati
15
2
30
Rehberli Problem Çözme
15
6
90
Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi
4
50
200
Okul Dışı Diğer Faaliyetler
0
0
0
Proje Sunumu / Seminer
1
50
50
Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı
0
0
0
Ara Sınav ve Hazırlığı
1
30
30
Genel Sınav ve Hazırlığı
1
50
50
Performans Görevi, Bakım Planı
0
0
0
Total Workload(Hour)
450
Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(450/30)
15
ECTS of the course: 30 hours of work is counted as 1 ECTS credit.
Detail Informations of the Course
Course Description
Course
Code
Semester
T+P (Hour)
Credit
ECTS
İNSAN MİKROBİYOMU
MKBD2131370
Güz Dönemi
2+0
2
15
Course Program
Prerequisites Courses
Recommended Elective Courses
Language of Course
Türkçe
Course Level
Doktora
Course Type
Programa Bağlı Seçmeli
Course Coordinator
Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM
Name of Lecturer(s)
Prof.Dr. Süleyman YILDIRIM
Assistant(s)
Aim
İnsan Mikrobiyomu dersinin amacı insan mikrobiyomunun bileşimi, işlevsel önemi ve insan sağlığı ve hastalığı ile olan karmaşık ilişkisini kapsayan kapsamlı bir anlayış sağlamaktır.
Course Content
Bu ders; Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları,Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi,Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti,Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler,Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü); konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Teaching Methods
Assessment Methods
1. Bileşimi, çeşitliliği ve mikrobiyal topluluklar ile insan konakçı arasındaki dinamik etkileşimlerini açıklar
2. Mikrobiyal toplulukları taksonomik ve işlevsel düzeyde analiz etmek için metagenomik ve metatranskriptomik gibi teknikleri kullanarak mikrobiyom verilerinin değerlendirilmesi ve yorumlanmasında ileri analitik beceriler geliştirir
3. Mikrobiyomun bulaşıcı hastalıklardan kronik durumlara kadar insan hastalıklarındaki rolünü keşfetmek ve mikrobiyal toplulukların sağlığı etkileme ve hastalık durumlarına katkıda bulunma mekanizmalarını açıklar
4. Karmaşık mikrobiyal ekosistemleri incelemek için çoklu omik verileri entegre etme konusunda yetkinlik kazanmak ve mikrobiyomun işlevsel yönlerini çözmede omik yaklaşımlarını açıklar
Teaching Methods:
Assessment Methods:
Course Outline
Order
Subjects
Preliminary Work
1
Mikrobiyom araştırmalarında tarihsel perspektif ve kilometre taşları
2
Sağlık ve hastalıkta insan mikrobiyomunun önemi
3
Taksonomik ve fonksiyonel profillemenin anlaşılması ve mikrobiyal topluluk analizi için tekniklerin özeti
4
Metagenomik ve Metatranskriptomik analizler
5
Mikrobiyom ve İnsan Hastalıkları (Mikrobiyomun bulaşıcı ve kronik hastalıklardaki rolü)
Resources
1. Bioinformatic and Statistical Analysis of Microbiome Data: From Raw Sequences to Advanced Modeling with Qiime 2 and R,
2. Human-Gut Microbiome, Gunjan Goel, Teresa Requena, Saurabh Bansal ( ISBN: 9780323913133)
3. Bilimsel makaleler
Course Contribution to Program Qualifications
Course Contribution to Program Qualifications
No
Program Qualification
Contribution Level
1
2
3
4
5
1
Bilimsel araştırmaların planlanması ve istatistiksel değerlendirmesini yapar, sonuçlarını hakemli bir dergide yayinlamak uzere makale hazirlar ve/veya bilimsel bir toplantıda sunar.
2
Tıbbi Mikrobiyoloji alanında kullanılan laboratuvar yöntemlerini bilir ve mikroorganizmalarla ilgili deneysel calisma tasarimi yapar.
3
Mikrobiyoloji alanında yüksek düzeyde güncel bilimsel bilgi ve beceri kazanır ve alanındaki yenilikleri takip eder.
X
4
Uygulamalı temel mikrobiyoloji laboratuvarında rutin ve araştırma amacına hizmet eden cihaz ve aletlerin kullanımını bilir
5
Bilimsel çalışma sonuçlarını uzmanlik düzeyinde istatistiksel analizlerini yapma, degerlendirme, savunma ve yazili ya da sozlu sunma yetenekleri geliştirir.
X
6
Bilimsel proje yazma yetkinligi gelistirir.
7
Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer.
X
8
Tıbbi Mikrobiyoloji alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, seminerler verir
9
Mikrobiyal hastalıkları ve etiyolojisini uzmanlık düzeyinde anlar ve yorumlar.
