Course Detail
Course Description
| Course | Code | Semester | T+P (Hour) | Credit | ECTS |
|---|---|---|---|---|---|
| İLERİ MOLEKÜLER TEKNİKLER | TBGY1235970 | Bahar Dönemi | 1+2 | 2 | 6 |
| Course Program |
| Prerequisites Courses | |
| Recommended Elective Courses |
| Language of Course | Türkçe |
| Course Level | Yüksek Lisans |
| Course Type | Programa Bağlı Seçmeli |
| Course Coordinator | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ |
| Name of Lecturer(s) | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Prof.Dr. Kürşat ÖZDİLLİ, Doç.Dr. Nihal KARAKAŞ, Doç.Dr. İlyas ÖZÇİÇEK, Dr.Öğr.Üye. Neşe AYŞİT, Dr.Öğr.Üye. Elif Zeynep YILMAZ, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER, Dr.Öğr.Üye. Sven Pıerre L. VILAIN, Dr.Öğr.Üye. Yasemin YOZGAT BYRNE, Dr.Öğr.Üye. Behnaz KARADOĞAN, Dr.Öğr.Üye. Esra YALÇIN |
| Assistant(s) | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Prof.Dr. Kürşat ÖZDİLLİ, Dr.Öğr.Üye. Neşe AYŞİT, Doç.Dr. Nihal KARAKAŞ, Dr.Öğr.Üye. Berrak ÇAĞLAYAN, Dr.Öğr.Üye. İlyas ÖZÇİÇEK, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER, Dr.Öğr.Üye. Elif Zeynep YILMAZ, Dr.Öğr.Üye. Sven Pierre L. VILAIN, Dr.Öğr.Üye. Muzaffer ARIKAN |
| Aim | Bu ders kapsamında öğrencilerin RNA, protein seviyesinde temel moleküler teknikleri, hücre kültür ve görüntüleme ve temel doku muamele tekniklerinin çalışma prensiplerini kavraması ve pratik kazanmasını amaçlamaktadır. |
| Course Content | Bu ders; Çözelti hazırlama, Ph ayarlama ve otoklavlama ,Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ve agarose jel elektroforezi ,Kantitatif Gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) reaksiyonu ve analizi ,SDS-PAGE jel hazırlama ve yürütme ,Western Blot Analizi ,Hücre Canlılık Testleri (MTT vb) ,Temel İstatistiksel Analizler ,Hücre Kültürü kuralları ve yöntemleri ,Hücre kültüründe pasajlama, hücre sayımı ve dondurma ,İmmünositokimyanin temelleri ,Doku koruma yöntemleri ve kesit alma Tissue Preservation methodologies and tissue sectioning ,İmmünohistokimyanın temelleri ,İmmünfloresan Mikroskop Kullanımı ,Görüntü Analizi yöntemleri ; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Teaching Methods | Assessment Methods |
| RNA, protein seviyesinde temel moleküler teknikleri açıklar | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Western Blot, qRTPCR vb tekniklerin çalışma prensiplerini açıklar. | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Hücre kültürü prensiplerini açıklar Explains and applies cell culture principles | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Hücre ve doku boyutunda immünboyama ve floresan görüntüleme yöntemlerini yorumlar. | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Teaching Methods: | 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 17: Deney yapma Tekniği, 9: Anlatım Yöntemi |
| Assessment Methods: | A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev |
Course Outline
| Order | Subjects | Preliminary Work |
|---|---|---|
| 1 | Çözelti hazırlama, Ph ayarlama ve otoklavlama | |
| 2 | Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ve agarose jel elektroforezi | |
| 3 | Kantitatif Gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) reaksiyonu ve analizi | |
| 4 | SDS-PAGE jel hazırlama ve yürütme | |
| 5 | Western Blot Analizi | |
| 6 | Hücre Canlılık Testleri (MTT vb) | |
| 7 | Temel İstatistiksel Analizler | |
| 8 | Hücre Kültürü kuralları ve yöntemleri | |
| 9 | Hücre kültüründe pasajlama, hücre sayımı ve dondurma | |
| 10 | İmmünositokimyanin temelleri | |
| 11 | Doku koruma yöntemleri ve kesit alma Tissue Preservation methodologies and tissue sectioning | |
| 12 | İmmünohistokimyanın temelleri | |
| 13 | İmmünfloresan Mikroskop Kullanımı | |
| 14 | Görüntü Analizi yöntemleri |
| Resources |
| Laboratuvarlarda verilen teknik bilgi ve kılavuzlar |
Course Contribution to Program Qualifications
| Course Contribution to Program Qualifications | |||||||
| No | Program Qualification | Contribution Level | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | - Hücre yapısını, görevlerini ve farklı hücre çeşitlerini tanımlar. | X | |||||
| 2 | Hücrenin organelleri, görevleri ve birbiriyle iletişimini tanımlar. | X | |||||
| 3 | Hücrenin temel yapı ve işleyişindeki bozukluklarla ilgili yorum yapabilir. | X | |||||
| 4 | Laboratuvar gereçlerini ve kullanımını açıklar. | X | |||||
| 5 | Laboratuvarda kullanılan temel cihazları ve kullanım alanlarını tanımlar. | X | |||||
| 6 | Laboratuvarda uyulması gereken kuralları ve güvenlik konularını açıklar. | X | |||||
| 7 | Bilimsel çalışmaya yönelik hipotez geliştirebilir. | X | |||||
| 8 | Klinik ya da klinik olmayan çalışmalara katılabilir, yöntem önerilerinde bulunabilir. | X | |||||
| 9 | Yeni ve gelişmekte olan uygulamaları bilme, gerektiğinde bunları etkili bir biçimde kullanma ve öğretme becerisi geliştirir. | X | |||||
| 10 | Bilimsel araştırma planlayabilir. | X | |||||
| 11 | Bilimsel veri tabanlarını kullanabilir. | X | |||||
| 12 | Alanı ile ilgili sahip olduğu temel bilgi birikimini kullanarak verilen bir görevi bağımsız olarak yürütür. | X | |||||
| 13 | Alanında edindiği temel düzeydeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirir; öğrenme gereksinimlerini belirler ve yönlendirir. | X | |||||
| 14 | Alanı ile ilgili ve bilimsel araştırma konularında başkaları ile iletişim kurarak, bilgi ve fikir alışverişi yapabilir. | X | |||||
| 15 | Alınanda yapılan çalışmaları ileri düzey yabancı dil bilgisi ve bilgisayar yetileri ile takip eder ve kullanır. | X | |||||
| 16 | Alanıyla ilgili görev, hak ve sorumlulukları ile ilgili yasa, yönetmelik, mevzuat ve mesleki etik kurallarına uygun davranır. | X | |||||
| 17 | Alanı ile ilgili sahip olduğu temel bilgi birikimini kullanarak verilen bir görevi bağımsız olarak yürütür. | X | |||||
Assessment Methods
| Contribution Level | Absolute Evaluation | |
| Rate of Midterm Exam to Success | 50 | |
| Rate of Final Exam to Success | 50 | |
| Total | 100 | |
| ECTS / Workload Table | ||||||
| Activities | Number of | Duration(Hour) | Total Workload(Hour) | |||
| Ders Saati | 14 | 3 | 42 | |||
| Rehberli Problem Çözme | 14 | 2 | 28 | |||
| Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi | 14 | 3 | 42 | |||
| Okul Dışı Diğer Faaliyetler | 0 | 0 | 0 | |||
| Proje Sunumu / Seminer | 0 | 0 | 0 | |||
| Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 | |||
| Ara Sınav ve Hazırlığı | 1 | 30 | 30 | |||
| Genel Sınav ve Hazırlığı | 1 | 30 | 30 | |||
| Performans Görevi, Bakım Planı | 0 | 0 | 0 | |||
| Total Workload(Hour) | 172 | |||||
| Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(172/30) | 6 | |||||
| ECTS of the course: 30 hours of work is counted as 1 ECTS credit. | ||||||
Detail Informations of the Course
Course Description
| Course | Code | Semester | T+P (Hour) | Credit | ECTS |
|---|---|---|---|---|---|
| İLERİ MOLEKÜLER TEKNİKLER | TBGY1235970 | Bahar Dönemi | 1+2 | 2 | 6 |
| Course Program |
| Prerequisites Courses | |
| Recommended Elective Courses |
| Language of Course | Türkçe |
| Course Level | Yüksek Lisans |
| Course Type | Programa Bağlı Seçmeli |
| Course Coordinator | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ |
| Name of Lecturer(s) | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Prof.Dr. Kürşat ÖZDİLLİ, Doç.Dr. Nihal KARAKAŞ, Doç.Dr. İlyas ÖZÇİÇEK, Dr.Öğr.Üye. Neşe AYŞİT, Dr.Öğr.Üye. Elif Zeynep YILMAZ, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER, Dr.Öğr.Üye. Sven Pıerre L. VILAIN, Dr.Öğr.Üye. Yasemin YOZGAT BYRNE, Dr.Öğr.Üye. Behnaz KARADOĞAN, Dr.Öğr.Üye. Esra YALÇIN |
| Assistant(s) | Prof.Dr. Esra ÇAĞAVİ, Prof.Dr. Kürşat ÖZDİLLİ, Dr.Öğr.Üye. Neşe AYŞİT, Doç.Dr. Nihal KARAKAŞ, Dr.Öğr.Üye. Berrak ÇAĞLAYAN, Dr.Öğr.Üye. İlyas ÖZÇİÇEK, Dr.Öğr.Üye. Salih GENCER, Dr.Öğr.Üye. Elif Zeynep YILMAZ, Dr.Öğr.Üye. Sven Pierre L. VILAIN, Dr.Öğr.Üye. Muzaffer ARIKAN |
| Aim | Bu ders kapsamında öğrencilerin RNA, protein seviyesinde temel moleküler teknikleri, hücre kültür ve görüntüleme ve temel doku muamele tekniklerinin çalışma prensiplerini kavraması ve pratik kazanmasını amaçlamaktadır. |
| Course Content | Bu ders; Çözelti hazırlama, Ph ayarlama ve otoklavlama ,Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ve agarose jel elektroforezi ,Kantitatif Gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) reaksiyonu ve analizi ,SDS-PAGE jel hazırlama ve yürütme ,Western Blot Analizi ,Hücre Canlılık Testleri (MTT vb) ,Temel İstatistiksel Analizler ,Hücre Kültürü kuralları ve yöntemleri ,Hücre kültüründe pasajlama, hücre sayımı ve dondurma ,İmmünositokimyanin temelleri ,Doku koruma yöntemleri ve kesit alma Tissue Preservation methodologies and tissue sectioning ,İmmünohistokimyanın temelleri ,İmmünfloresan Mikroskop Kullanımı ,Görüntü Analizi yöntemleri ; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Teaching Methods | Assessment Methods |
| RNA, protein seviyesinde temel moleküler teknikleri açıklar | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Western Blot, qRTPCR vb tekniklerin çalışma prensiplerini açıklar. | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Hücre kültürü prensiplerini açıklar Explains and applies cell culture principles | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Hücre ve doku boyutunda immünboyama ve floresan görüntüleme yöntemlerini yorumlar. | 13, 14, 17, 9 | A, E |
| Teaching Methods: | 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 17: Deney yapma Tekniği, 9: Anlatım Yöntemi |
| Assessment Methods: | A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev |
Course Outline
| Order | Subjects | Preliminary Work |
|---|---|---|
| 1 | Çözelti hazırlama, Ph ayarlama ve otoklavlama | |
| 2 | Polimeraz Zincir reaksiyonu (PCR) ve agarose jel elektroforezi | |
| 3 | Kantitatif Gerçek zamanlı PCR (qRT-PCR) reaksiyonu ve analizi | |
| 4 | SDS-PAGE jel hazırlama ve yürütme | |
| 5 | Western Blot Analizi | |
| 6 | Hücre Canlılık Testleri (MTT vb) | |
| 7 | Temel İstatistiksel Analizler | |
| 8 | Hücre Kültürü kuralları ve yöntemleri | |
| 9 | Hücre kültüründe pasajlama, hücre sayımı ve dondurma | |
| 10 | İmmünositokimyanin temelleri | |
| 11 | Doku koruma yöntemleri ve kesit alma Tissue Preservation methodologies and tissue sectioning | |
| 12 | İmmünohistokimyanın temelleri | |
| 13 | İmmünfloresan Mikroskop Kullanımı | |
| 14 | Görüntü Analizi yöntemleri |
| Resources |
| Laboratuvarlarda verilen teknik bilgi ve kılavuzlar |
Course Contribution to Program Qualifications
| Course Contribution to Program Qualifications | |||||||
| No | Program Qualification | Contribution Level | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | - Hücre yapısını, görevlerini ve farklı hücre çeşitlerini tanımlar. | X | |||||
| 2 | Hücrenin organelleri, görevleri ve birbiriyle iletişimini tanımlar. | X | |||||
| 3 | Hücrenin temel yapı ve işleyişindeki bozukluklarla ilgili yorum yapabilir. | X | |||||
| 4 | Laboratuvar gereçlerini ve kullanımını açıklar. | X | |||||
| 5 | Laboratuvarda kullanılan temel cihazları ve kullanım alanlarını tanımlar. | X | |||||
| 6 | Laboratuvarda uyulması gereken kuralları ve güvenlik konularını açıklar. | X | |||||
| 7 | Bilimsel çalışmaya yönelik hipotez geliştirebilir. | X | |||||
| 8 | Klinik ya da klinik olmayan çalışmalara katılabilir, yöntem önerilerinde bulunabilir. | X | |||||
| 9 | Yeni ve gelişmekte olan uygulamaları bilme, gerektiğinde bunları etkili bir biçimde kullanma ve öğretme becerisi geliştirir. | X | |||||
| 10 | Bilimsel araştırma planlayabilir. | X | |||||
| 11 | Bilimsel veri tabanlarını kullanabilir. | X | |||||
| 12 | Alanı ile ilgili sahip olduğu temel bilgi birikimini kullanarak verilen bir görevi bağımsız olarak yürütür. | X | |||||
| 13 | Alanında edindiği temel düzeydeki bilgi ve becerileri eleştirel bir yaklaşımla değerlendirir; öğrenme gereksinimlerini belirler ve yönlendirir. | X | |||||
| 14 | Alanı ile ilgili ve bilimsel araştırma konularında başkaları ile iletişim kurarak, bilgi ve fikir alışverişi yapabilir. | X | |||||
| 15 | Alınanda yapılan çalışmaları ileri düzey yabancı dil bilgisi ve bilgisayar yetileri ile takip eder ve kullanır. | X | |||||
| 16 | Alanıyla ilgili görev, hak ve sorumlulukları ile ilgili yasa, yönetmelik, mevzuat ve mesleki etik kurallarına uygun davranır. | X | |||||
| 17 | Alanı ile ilgili sahip olduğu temel bilgi birikimini kullanarak verilen bir görevi bağımsız olarak yürütür. | X | |||||
Assessment Methods
| Contribution Level | Absolute Evaluation | |
| Rate of Midterm Exam to Success | 50 | |
| Rate of Final Exam to Success | 50 | |
| Total | 100 | |