Ders Detayı
Ders Tanımı
| Ders | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| MİKROBİYOLOJİDE MOLEKÜLER YÖNTEMLER | 2+4 | 4 | 15 |
| Ders Programı |
| Ön Koşul Dersleri | |
| Önerilen Seçmeli Dersler |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Programa Bağlı Seçmeli |
| Dersin Koordinatörü | Dr.Öğr.Üye. Özlem GÜVEN |
| Dersi Verenler | Dr.Öğr.Üye. Özlem GÜVEN |
| Dersin Yardımcıları | |
| Dersin Amacı | Mikroorganizmaların örnekte saptanmasında, tanımlanmalarında ve antimikrobiyal direncin belirlenmesinde kullanılan moleküler biyoloji tekniklerini açıklamak ve temel teknikleri uygulamak |
| Dersin İçeriği | Bu ders; Mikroorganizma genetik bilgisine erişim (web siteleri, programlar ve kullanım uygulaması),Nükleik asit izolasyonunda kullanılan yöntemler,Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ,Kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR),RNA saptanmasında kullanılan yöntemler; RT-PCR, RT-qPCR,Dijital PCR,Sanger dizileme yöntemi,Yeni nesil dizileme yöntemleri - I,Yeni nesil dizileme yöntemleri - II,Mikrobiyal tüm genom dizileme: klinik mikrobiyoloji ve halk sağlığı alanında uygulanması,Mikroorganizma genotiplendirmede kullanılan yöntemler,Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında güncel yöntemler,Moleküler biyolojide kullanılan yöntemlerde karşılaşılan teknik sorunlar ve çözüm önerileri,Moleküler mikrobiyoloji testlerinde özgüllük, duyarlılık ve sonuçların yorumlanmasıyla ilgili sorunlar ve çözüm önerileri; konularını içermektedir. |
| Dersin İçeriği | Öğretim Yöntemleri | Ölçme Yöntemleri |
| Mikrobiyoloji alanında kullanılan moleküler yöntemleri açıklamak ve temel yöntemleri uygulamak | 1, 13, 2, 3 | A |
| Moleküler biyoloji testlerinde sorunları değerlendirmek ve çözüm önerileri hakkında fikir yürütmek | 1, 13, 2, 3 | A |
| Öğretim Yöntemleri: | 1: Anlatım, 13: Deney / Laboratuvar, 2: Soru - Cevap, 3: Tartışma |
| Ölçme Yöntemleri: | A: Yazılı sınav |
Ders Akışı
| Sıra | Konular | Ön Hazırlık |
| 1 | Mikroorganizma genetik bilgisine erişim (web siteleri, programlar ve kullanım uygulaması) | |
| 2 | Nükleik asit izolasyonunda kullanılan yöntemler | |
| 3 | Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) | |
| 4 | Kantitatif polimeraz zincir reaksiyonu (qPCR) | |
| 5 | RNA saptanmasında kullanılan yöntemler; RT-PCR, RT-qPCR | |
| 6 | Dijital PCR | |
| 7 | Sanger dizileme yöntemi | |
| 8 | Yeni nesil dizileme yöntemleri - I | |
| 9 | Yeni nesil dizileme yöntemleri - II | |
| 10 | Mikrobiyal tüm genom dizileme: klinik mikrobiyoloji ve halk sağlığı alanında uygulanması | |
| 11 | Mikroorganizma genotiplendirmede kullanılan yöntemler | |
| 12 | Moleküler mikrobiyoloji laboratuvarında güncel yöntemler | |
| 13 | Moleküler biyolojide kullanılan yöntemlerde karşılaşılan teknik sorunlar ve çözüm önerileri | |
| 14 | Moleküler mikrobiyoloji testlerinde özgüllük, duyarlılık ve sonuçların yorumlanmasıyla ilgili sorunlar ve çözüm önerileri |
| Kaynak |
| 1. Koneman's Color Atlas And Textbook of Diagnostic Microbiology. 7th edt. Jones & Bartlett Learning; 2016. 2. PCR Detection of Microbial Pathogens. Humana Press, 2016. 3. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice. 3. Edt. ASM Press, 2016 |
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
| Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı | |||||||
| No | Program Yeterliliği | Katkı Düzeyi | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 0 | Bilimsel araştırmaların planlanması ve istatistiksel değerlendirmesini yapar, sonuçlarını hakemli bir dergide yayinlamak uzere makale hazirlar ve/veya bilimsel bir toplantıda sunar. | X | |||||
| 0 | Tıbbi Mikrobiyoloji alanında kullanılan laboratuvar yöntemlerini bilir ve mikroorganizmalarla ilgili deneysel calisma tasarimi yapar. | X | |||||
| 0 | Mikrobiyoloji alanında yüksek düzeyde güncel bilimsel bilgi ve beceri kazanır ve alanındaki yenilikleri takip eder. | X | |||||
| 0 | Uygulamalı temel mikrobiyoloji laboratuvarında rutin ve araştırma amacına hizmet eden cihaz ve aletlerin kullanımını bilir | X | |||||
| 0 | Bilimsel çalışma sonuçlarını uzmanlik düzeyinde istatistiksel analizlerini yapma, degerlendirme, savunma ve yazili ya da sozlu sunma yetenekleri geliştirir. | ||||||
| 0 | Bilimsel proje yazma yetkinligi gelistirir. | X | |||||
| 0 | Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer. | X | |||||
| 0 | Tıbbi Mikrobiyoloji alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, seminerler verir | X | |||||
| 0 | Mikrobiyal hastalıkları ve etiyolojisini uzmanlık düzeyinde anlar ve yorumlar. | X | |||||
Değerlendirme Sistemi
| Katkı Düzeyi | Mutlak Değerlendirme | |
| Ara Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Genel Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Toplam | 100 | |