Ders Detayı
Ders Tanımı
| Ders | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BİYOKİMYADA ENSTRÜMENTAL ANALİZ II | - | Bahar Dönemi | 2+2 | 3 | 6 |
| Ders Programı |
| Ön Koşul Dersleri | |
| Önerilen Seçmeli Dersler |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Programa Bağlı Seçmeli |
| Dersin Koordinatörü | |
| Dersi Verenler | Prof.Dr. Neslin EMEKLİ, Prof.Dr. Türkan YİĞİTBAŞI, Doç.Dr. Sultan Sibel ERDEM, Dr.Öğr.Üye. Gözde ÜLFER, Dr.Öğr.Üye. Çağrı ÇAKICI, Dr.Öğr.Üye. Derya CANSIZ |
| Dersin Yardımcıları | |
| Dersin Amacı | Biyokimyasal araştırmalarda kullanılan analitik tetkikleri ve işletimine ilişkin ana prensipleri ileri düzeyde öğretmektir. |
| Dersin İçeriği | Bu ders; Spektrometrik yöntemlere giriş,Optik cihazlar,Moleküler absorpsiyon ve görünür bölge,Atomik spektroskopi,Floresans spektrometri,Atomik emisyon spektrometri,Atomik kütle spektrometri,Moleküler spektroskopi,İnfrared spektrometri,Moleküler luminesans spektrometri,X-Işını kristalografisi,Mikroçip teknolojisi,Elektroanalitik yöntemler ve pH,Nüklear magnetik rezonans spektrometri; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Öğretim Yöntemleri | Ölçme Yöntemleri |
| 1-Elektromanyetik ışıma ve çeşitli spektrofotometrileri sorgulayabilir | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.1.Görünür ışın, X ışınları, Ultraviyole, kızılötesi, mikrodalga ve radyo dalgaları sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.2.Işının yansıması, saçılması, polarizasyonu ve absorblanmasını açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.4.Spektrometri ve fotometri kavramlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.5.Spektrofotometrenin temel parçalarını açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.6.Tercih edilen spektrometrelerin özelliklerini ve spektrofotometrenin kalibrasyonunu açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.7.Nefolometri, florometri, atomik spektrometri, flame ve inifraret spektrometriyi sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2-Kütle spektrometresini sorgular. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.2.Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçus süresi kütle spektrometresinin (MALDİ ) lazer ışınları ile ilişkisini iyonların detektöre uçuş süresini (TOF) açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.3.MALDİ-TOF’un kullanım alanlarını sorgular. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.5.Protein çip teknolojileri ile 2 dimensiyonlu elektroforez yöntemi ilişkisini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.6.Elektrospray iyonizasyon kütle spektrometresinin özelliklerini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.7.Gaz kromatografisi-kütle spektrometresi ilişkisini açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3-Elektroanalitik yöntemler ve pH kavramlarını sorgulayabilir | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.1.Çözeltinin elektrokimyasal özelliklerini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.2.Elektroanalitik yöntemlerin çalışma prensiplerini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.4.pH ölçümünün kullanım alanlarının önemini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4-Nüklear manyetik rezonans spektrometresini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.1.Radyo dalgasi manyetik alan ilişkisini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.2.Elektromanyetik bir alana konulan yüklü bir çekirdekteki enerji seviyesi değişimini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | E |
| 4.3.Nüklear manyetik rezonans spektrometresinde kullanılan Hidrojen, karbon, azot gibi radyoaktif çekirdek tiplerini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.4.Nüklear manyetik rezonans spektrometrisinin uygulama alanlarını açıklar. | 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.5.X-ışını kristalografisi yöntemi ile enzim-protein yapılarının aydınlatılmasını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.3. Lambert-Beer yasasını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.1. Kütle spektrometresinin prensibini ve çalışma alanlarını açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.4. SELDİ-TOF kütle spektrofotometresini ve kullanım alanlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.8. Sıvı kromatografisi-kütle spektrometresi ilişkisini açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.9. Ardışık kütle spektrometresinin (TANDEM ) özelliklerini ve kullanım alanlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.3. İşlemsel pH ölçümü için gerekli bilgi ve beceriyi sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| Öğretim Yöntemleri: | 10: Tartışma Yöntemi, 11: Gösterip Yapma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 19: Beyin Fırtınası Tekniği, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli, 9: Anlatım Yöntemi |
| Ölçme Yöntemleri: | A: Klasik Yazılı Sınav, D: Sözlü Sınav, E: Ödev |
Ders Akışı
| Sıra | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Spektrometrik yöntemlere giriş | 1, 2 |
| 2 | Optik cihazlar | 1, 2 |
| 3 | Moleküler absorpsiyon ve görünür bölge | 1, 2 |
| 4 | Atomik spektroskopi | 1, 2 |
| 5 | Floresans spektrometri | 1, 2 |
| 6 | Atomik emisyon spektrometri | 1, 2 |
| 7 | Atomik kütle spektrometri | 1, 2 |
| 8 | Moleküler spektroskopi | 1, 2 |
| 9 | İnfrared spektrometri | 1, 2 |
| 10 | Moleküler luminesans spektrometri | 1, 2 |
| 11 | X-Işını kristalografisi | 1, 2 |
| 12 | Mikroçip teknolojisi | 1, 2 |
| 13 | Elektroanalitik yöntemler ve pH | 1, 2 |
| 14 | Nüklear magnetik rezonans spektrometri | 1, 2 |
| Kaynak |
| 1) Clinical chemistry ; Theory , analysis , correlation ed.Lawrence A.Kaplan, Amadeo J.Pesce , Mosby Elsevier 5. Baskı, 2010Tietz, 2) Klinik kimyada temel ilkeler 5.baskı çeviri ed. Carl A. Burtis , ER, Ashwood çeviri ed. Diler Aslan Palme Yayıncılık, 2005 |
| Enstrümental Analiz ilkeleri(Prof.Dr.Sema Kılıç,Prof.Dr.Fitnat Köseoğlu,Doç.Dr.Hamza Yılmaz) |
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
| Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı | |||||||
| No | Program Yeterliliği | Katkı Düzeyi | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | Hücre ve vücut sıvılarında bulunan makro ve mikromolekülleri ileri düzeyde tanımlar. | X | |||||
| 2 | Analiz edilecek materyalın nasıl saklanacağını, korunacağını bilir. | X | |||||
| 3 | Hücre ve vücut sıvılarında bulunan moleküllerin nasıl tanımlanabileceğini bilir . | X | |||||
| 4 | Rutin ve araştırma amaçlı kullanılacak teknolojilerin prensiplerini bilir. | X | |||||
| 5 | Çalışma sonuçlarını nasıl değerlendireceğini bilir, yorumlar ve sorgular. | X | |||||
| 6 | Alana özgü araç ve gereçlerin nasıl kullanılacağını bilir | X | |||||
| 7 | Alana özgü kaynak ve bilgilere nasıl ulaşacağını ve nasıl yorumlanacağını bilir | X | |||||
| 8 | Alanla ilgili disiplinlerle bilgi paylaşımı yapar | X | |||||
| 9 | Kuramsal ve olgusal bilgilerini, eleştirisel düşünceleri ile birleştirerek bağımsız çalışma yapar, sonuçlarını değerlendirir, literatür bilgileri ile karşılaştırır, yazar ve bilimsel dergilere kabul ettirir. | X | |||||
| 10 | Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer, nereden yardım alması gerektiğini bilir. | X | |||||
| 11 | Ortak bilimsel çalışmalarda sorumluluk alır, katkıda bulunur ve uyum içinde çalışır. | X | |||||
| 12 | Biyokimya alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, konferanslar verir, çalışmalarını alan özgü itibarlı dergilerde yayınlar | X | |||||
| 13 | Biyokimya alanı ile ilgili verileri toplar, yorumlar, uygular, duyurur, , toplumsal kültürel çalışmalarda bulunur, bu çalışmaları bilimsel ve sosyal anlamda denetleyebilir. | X | |||||
| 14 | Yönetim aktivitelerinde bulunabilir, elde ettiği sonuçları kaliteyi yükseltmek için değerlendirebilir. | ||||||
Değerlendirme Sistemi
| Katkı Düzeyi | Mutlak Değerlendirme | |
| Ara Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Genel Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Toplam | 100 | |
| AKTS / İşyükü Tablosu | ||||||
| Etkinlik | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İş Yükü (Saat) | |||
| Ders Saati | 14 | 2 | 28 | |||
| Rehberli Problem Çözme | 14 | 4 | 56 | |||
| Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi | 2 | 5 | 10 | |||
| Okul Dışı Diğer Faaliyetler | 2 | 5 | 10 | |||
| Proje Sunumu / Seminer | 2 | 1 | 2 | |||
| Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı | 0 | 0 | 0 | |||
| Ara Sınav ve Hazırlığı | 1 | 25 | 25 | |||
| Genel Sınav ve Hazırlığı | 1 | 35 | 35 | |||
| Performans Görevi, Bakım Planı | 0 | 0 | 0 | |||
| Toplam İş Yükü (Saat) | 166 | |||||
| Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(166/30) | 6 | |||||
| Dersin AKTS Kredisi: *30 saatlik çalışma 1 AKTS kredisi sayılmaktadır. | ||||||
Dersin Detaylı Bilgileri
Ders Tanımı
| Ders | Kodu | Yarıyıl | T+U Saat | Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|
| BİYOKİMYADA ENSTRÜMENTAL ANALİZ II | - | Bahar Dönemi | 2+2 | 3 | 6 |
| Ders Programı |
| Ön Koşul Dersleri | |
| Önerilen Seçmeli Dersler |
| Dersin Dili | Türkçe |
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Programa Bağlı Seçmeli |
| Dersin Koordinatörü | |
| Dersi Verenler | Prof.Dr. Neslin EMEKLİ, Prof.Dr. Türkan YİĞİTBAŞI, Doç.Dr. Sultan Sibel ERDEM, Dr.Öğr.Üye. Gözde ÜLFER, Dr.Öğr.Üye. Çağrı ÇAKICI, Dr.Öğr.Üye. Derya CANSIZ |
| Dersin Yardımcıları | |
| Dersin Amacı | Biyokimyasal araştırmalarda kullanılan analitik tetkikleri ve işletimine ilişkin ana prensipleri ileri düzeyde öğretmektir. |
| Dersin İçeriği | Bu ders; Spektrometrik yöntemlere giriş,Optik cihazlar,Moleküler absorpsiyon ve görünür bölge,Atomik spektroskopi,Floresans spektrometri,Atomik emisyon spektrometri,Atomik kütle spektrometri,Moleküler spektroskopi,İnfrared spektrometri,Moleküler luminesans spektrometri,X-Işını kristalografisi,Mikroçip teknolojisi,Elektroanalitik yöntemler ve pH,Nüklear magnetik rezonans spektrometri; konularını içermektedir. |
| Dersin Öğrenme Kazanımları | Öğretim Yöntemleri | Ölçme Yöntemleri |
| 1-Elektromanyetik ışıma ve çeşitli spektrofotometrileri sorgulayabilir | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.1.Görünür ışın, X ışınları, Ultraviyole, kızılötesi, mikrodalga ve radyo dalgaları sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.2.Işının yansıması, saçılması, polarizasyonu ve absorblanmasını açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.4.Spektrometri ve fotometri kavramlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.5.Spektrofotometrenin temel parçalarını açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.6.Tercih edilen spektrometrelerin özelliklerini ve spektrofotometrenin kalibrasyonunu açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.7.Nefolometri, florometri, atomik spektrometri, flame ve inifraret spektrometriyi sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2-Kütle spektrometresini sorgular. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.2.Matriks ile desteklenmiş lazer desorpsiyon/iyonizasyon uçus süresi kütle spektrometresinin (MALDİ ) lazer ışınları ile ilişkisini iyonların detektöre uçuş süresini (TOF) açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.3.MALDİ-TOF’un kullanım alanlarını sorgular. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.5.Protein çip teknolojileri ile 2 dimensiyonlu elektroforez yöntemi ilişkisini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.6.Elektrospray iyonizasyon kütle spektrometresinin özelliklerini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.7.Gaz kromatografisi-kütle spektrometresi ilişkisini açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3-Elektroanalitik yöntemler ve pH kavramlarını sorgulayabilir | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.1.Çözeltinin elektrokimyasal özelliklerini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.2.Elektroanalitik yöntemlerin çalışma prensiplerini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.4.pH ölçümünün kullanım alanlarının önemini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4-Nüklear manyetik rezonans spektrometresini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.1.Radyo dalgasi manyetik alan ilişkisini açıklar. | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.2.Elektromanyetik bir alana konulan yüklü bir çekirdekteki enerji seviyesi değişimini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | E |
| 4.3.Nüklear manyetik rezonans spektrometresinde kullanılan Hidrojen, karbon, azot gibi radyoaktif çekirdek tiplerini sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.4.Nüklear manyetik rezonans spektrometrisinin uygulama alanlarını açıklar. | 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 4.5.X-ışını kristalografisi yöntemi ile enzim-protein yapılarının aydınlatılmasını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 1.3. Lambert-Beer yasasını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.1. Kütle spektrometresinin prensibini ve çalışma alanlarını açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.4. SELDİ-TOF kütle spektrofotometresini ve kullanım alanlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.8. Sıvı kromatografisi-kütle spektrometresi ilişkisini açıklar | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 2.9. Ardışık kütle spektrometresinin (TANDEM ) özelliklerini ve kullanım alanlarını sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| 3.3. İşlemsel pH ölçümü için gerekli bilgi ve beceriyi sorgular | 10, 11, 16, 19, 6, 9 | A, D, E |
| Öğretim Yöntemleri: | 10: Tartışma Yöntemi, 11: Gösterip Yapma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 19: Beyin Fırtınası Tekniği, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli, 9: Anlatım Yöntemi |
| Ölçme Yöntemleri: | A: Klasik Yazılı Sınav, D: Sözlü Sınav, E: Ödev |
Ders Akışı
| Sıra | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Spektrometrik yöntemlere giriş | 1, 2 |
| 2 | Optik cihazlar | 1, 2 |
| 3 | Moleküler absorpsiyon ve görünür bölge | 1, 2 |
| 4 | Atomik spektroskopi | 1, 2 |
| 5 | Floresans spektrometri | 1, 2 |
| 6 | Atomik emisyon spektrometri | 1, 2 |
| 7 | Atomik kütle spektrometri | 1, 2 |
| 8 | Moleküler spektroskopi | 1, 2 |
| 9 | İnfrared spektrometri | 1, 2 |
| 10 | Moleküler luminesans spektrometri | 1, 2 |
| 11 | X-Işını kristalografisi | 1, 2 |
| 12 | Mikroçip teknolojisi | 1, 2 |
| 13 | Elektroanalitik yöntemler ve pH | 1, 2 |
| 14 | Nüklear magnetik rezonans spektrometri | 1, 2 |
| Kaynak |
| 1) Clinical chemistry ; Theory , analysis , correlation ed.Lawrence A.Kaplan, Amadeo J.Pesce , Mosby Elsevier 5. Baskı, 2010Tietz, 2) Klinik kimyada temel ilkeler 5.baskı çeviri ed. Carl A. Burtis , ER, Ashwood çeviri ed. Diler Aslan Palme Yayıncılık, 2005 |
| Enstrümental Analiz ilkeleri(Prof.Dr.Sema Kılıç,Prof.Dr.Fitnat Köseoğlu,Doç.Dr.Hamza Yılmaz) |
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
| Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı | |||||||
| No | Program Yeterliliği | Katkı Düzeyi | |||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |||
| 1 | Hücre ve vücut sıvılarında bulunan makro ve mikromolekülleri ileri düzeyde tanımlar. | X | |||||
| 2 | Analiz edilecek materyalın nasıl saklanacağını, korunacağını bilir. | X | |||||
| 3 | Hücre ve vücut sıvılarında bulunan moleküllerin nasıl tanımlanabileceğini bilir . | X | |||||
| 4 | Rutin ve araştırma amaçlı kullanılacak teknolojilerin prensiplerini bilir. | X | |||||
| 5 | Çalışma sonuçlarını nasıl değerlendireceğini bilir, yorumlar ve sorgular. | X | |||||
| 6 | Alana özgü araç ve gereçlerin nasıl kullanılacağını bilir | X | |||||
| 7 | Alana özgü kaynak ve bilgilere nasıl ulaşacağını ve nasıl yorumlanacağını bilir | X | |||||
| 8 | Alanla ilgili disiplinlerle bilgi paylaşımı yapar | X | |||||
| 9 | Kuramsal ve olgusal bilgilerini, eleştirisel düşünceleri ile birleştirerek bağımsız çalışma yapar, sonuçlarını değerlendirir, literatür bilgileri ile karşılaştırır, yazar ve bilimsel dergilere kabul ettirir. | X | |||||
| 10 | Bilimsel ve teknik bir sorunu çözer, nereden yardım alması gerektiğini bilir. | X | |||||
| 11 | Ortak bilimsel çalışmalarda sorumluluk alır, katkıda bulunur ve uyum içinde çalışır. | X | |||||
| 12 | Biyokimya alanı ile ilgili toplantılara katılır, bildiri sunar, tartışmalara katılır, konferanslar verir, çalışmalarını alan özgü itibarlı dergilerde yayınlar | X | |||||
| 13 | Biyokimya alanı ile ilgili verileri toplar, yorumlar, uygular, duyurur, , toplumsal kültürel çalışmalarda bulunur, bu çalışmaları bilimsel ve sosyal anlamda denetleyebilir. | X | |||||
| 14 | Yönetim aktivitelerinde bulunabilir, elde ettiği sonuçları kaliteyi yükseltmek için değerlendirebilir. | ||||||
Değerlendirme Sistemi
| Katkı Düzeyi | Mutlak Değerlendirme | |
| Ara Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Genel Sınavın Başarıya Oranı | 50 | |
| Toplam | 100 | |