Bu ders biyoenformatik ile ilgilenen öğrencilere lisans üstü seviyede güncel ve belirlenmiş araştırmalardan bahseder ve öğrencilere gelecek için araştırma fikirleri verir.
Dersin İçeriği
Bu ders; Temel Biyoenformatiğe giriş,Linux e giriş,Primer Biyoenformatik veri tabanları ve veri formatları,Bilimsel programlama ve biyoenformatik işakışları,Biyoenformatikte statistiksel sonuçlar ve veri tabanı madenciliği,Sekans dizilemesi ve metif araştıma metotları ,Filogenetik yapılandırma ve karsilaştırmalı genomiks,Proteinlerin yapısal biyoenformatiği,Genom veri analizi,Transkriptom veri analizi,Proteom veri analizi,Mıkrobiyom verı analızı,Ağ analizi ve sistemler biyolojisi,Biyoenformatikte öne çıkan hususlar ve güncel konular; konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
16, 37, 6
A, E, G
3, 37, 5, 6
A, E, G
10, 12, 16, 37, 6
A, E, G
10, 16, 37, 6
A, E, G
10, 13, 14, 16, 6
A, E, G
Öğretim Yöntemleri:
10: Tartışma Yöntemi, 12: Problem Çözme Yöntemi, 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 3: Probleme Dayalı Öğrenme Modeli, 37: Bilgisayar Ve İnternet Destekli Öğretim, 5: İşbirlikli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli
Ölçme Yöntemleri:
A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev, G: Kısa Sınav
Ders Akışı
Sıra
Konular
Ön Hazırlık
1
Temel Biyoenformatiğe giriş
2
Linux e giriş
3
Primer Biyoenformatik veri tabanları ve veri formatları
4
Bilimsel programlama ve biyoenformatik işakışları
5
Biyoenformatikte statistiksel sonuçlar ve veri tabanı madenciliği
6
Sekans dizilemesi ve metif araştıma metotları
7
Filogenetik yapılandırma ve karsilaştırmalı genomiks
8
Proteinlerin yapısal biyoenformatiği
9
Genom veri analizi
10
Transkriptom veri analizi
11
Proteom veri analizi
12
Mıkrobiyom verı analızı
13
Ağ analizi ve sistemler biyolojisi
14
Biyoenformatikte öne çıkan hususlar ve güncel konular
Kaynak
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
No
Program Yeterliliği
Katkı Düzeyi
1
2
3
4
5
1
Mühendislik alanında bilimsel araştırma yaparak bilgiye genişlemesine ve derinlemesine ulaşır, bilgiyi değerlendirir, yorumlar ve uygular.
X
2
Mühendislikte uygulanan güncel teknik ve yöntemler ile bunların kısıtları hakkında kapsamlı bilgi sahibidir ve mühendisliğin ilişki kurduğu disiplinler arası etkileşimi kavrayabilir.
X
3
Analitik, modelleme ve deneysel esaslı araştırmaları tasarlar ve uygular; bu süreçte karşılaşılan karmaşık durumları yorumlar, yeni ve özgün fikirler geliştirerek çözümler.
X
4
Sınırlı ya da eksik verileri kullanarak bilimsel yöntemlerle bilgiyi tamamlar ve uygular; değişik disiplinlere ait bilgileri bütünleştirir.
X
5
Mühendislik ile ilgili uzmanlık gerektiren bir çalışmayı bağımsız olarak yürütebilir.
X
6
Çok disiplinli takımlarda liderlik yapar, çözüm yaklaşımları geliştirir ve sorumluluk alır.
X
7
Mesleğinin yeni ve gelişmekte olan uygulamalarının farkındadır; gerektiğinde bunları inceler ve öğrenir.
X
8
Bilimsel bilgi birikimini yazılı ve sözlü olarak etkin bir şekilde ifade eder, en az bir yabancı dilde Avrupa Dil Portföyü B2 Genel Düzeyinde iletişim kurar ve iletişim teknolojilerini ileri düzeyde kullanır.
X
9
Mühendislik uygulamalarının sosyal ve çevresel boyutlarını betimler.
X
10
Verilerin toplanması, yorumlanması, duyurulması aşamalarında ve mesleki tüm etkinliklerde toplumsal, bilimsel ve etik değerleri gözetir.
X
Değerlendirme Sistemi
Katkı Düzeyi
Mutlak Değerlendirme
Ara Sınavın Başarıya Oranı
50
Genel Sınavın Başarıya Oranı
50
Toplam
100
AKTS / İşyükü Tablosu
Etkinlik
Sayı
Süresi (Saat)
Toplam İş Yükü (Saat)
Ders Saati
0
0
0
Rehberli Problem Çözme
0
0
0
Problem Çözümü / Ödev / Proje / Rapor Tanzimi
0
0
0
Okul Dışı Diğer Faaliyetler
0
0
0
Proje Sunumu / Seminer
0
0
0
Kısa Sınav (QUİZ) ve Hazırlığı
0
0
0
Ara Sınav ve Hazırlığı
0
0
0
Genel Sınav ve Hazırlığı
0
0
0
Performans Görevi, Bakım Planı
0
0
0
Toplam İş Yükü (Saat)
0
Dersin AKTS Kredisi = Toplam İş Yükü (Saat)/30*=(0/30)
0
Dersin AKTS Kredisi: *30 saatlik çalışma 1 AKTS kredisi sayılmaktadır.
Dersin Detaylı Bilgileri
Ders Tanımı
Ders
Kodu
Yarıyıl
T+U Saat
Kredi
AKTS
BİYOENFORMATİKTE SEÇİLİ KONULAR
-
Bahar Dönemi
3+0
3
8
Ders Programı
Ön Koşul Dersleri
Önerilen Seçmeli Dersler
Dersin Dili
İngilizce
Dersin Seviyesi
Yüksek Lisans
Dersin Türü
Programa Bağlı Seçmeli
Dersin Koordinatörü
Dersi Verenler
Dr.Öğr.Üye. Kıvanç KÖK
Dersin Yardımcıları
Dersin Amacı
Bu ders biyoenformatik ile ilgilenen öğrencilere lisans üstü seviyede güncel ve belirlenmiş araştırmalardan bahseder ve öğrencilere gelecek için araştırma fikirleri verir.
Dersin İçeriği
Bu ders; Temel Biyoenformatiğe giriş,Linux e giriş,Primer Biyoenformatik veri tabanları ve veri formatları,Bilimsel programlama ve biyoenformatik işakışları,Biyoenformatikte statistiksel sonuçlar ve veri tabanı madenciliği,Sekans dizilemesi ve metif araştıma metotları ,Filogenetik yapılandırma ve karsilaştırmalı genomiks,Proteinlerin yapısal biyoenformatiği,Genom veri analizi,Transkriptom veri analizi,Proteom veri analizi,Mıkrobiyom verı analızı,Ağ analizi ve sistemler biyolojisi,Biyoenformatikte öne çıkan hususlar ve güncel konular; konularını içermektedir.
Dersin Öğrenme Kazanımları
Öğretim Yöntemleri
Ölçme Yöntemleri
16, 37, 6
A, E, G
3, 37, 5, 6
A, E, G
10, 12, 16, 37, 6
A, E, G
10, 16, 37, 6
A, E, G
10, 13, 14, 16, 6
A, E, G
Öğretim Yöntemleri:
10: Tartışma Yöntemi, 12: Problem Çözme Yöntemi, 13: Örnek Olay Yöntemi, 14: Bireysel Çalışma Yöntemi, 16: Soru - Cevap Tekniği , 3: Probleme Dayalı Öğrenme Modeli, 37: Bilgisayar Ve İnternet Destekli Öğretim, 5: İşbirlikli Öğrenme Modeli, 6: Deneyimle Öğrenme Modeli
Ölçme Yöntemleri:
A: Klasik Yazılı Sınav, E: Ödev, G: Kısa Sınav
Ders Akışı
Sıra
Konular
Ön Hazırlık
1
Temel Biyoenformatiğe giriş
2
Linux e giriş
3
Primer Biyoenformatik veri tabanları ve veri formatları
4
Bilimsel programlama ve biyoenformatik işakışları
5
Biyoenformatikte statistiksel sonuçlar ve veri tabanı madenciliği
6
Sekans dizilemesi ve metif araştıma metotları
7
Filogenetik yapılandırma ve karsilaştırmalı genomiks
8
Proteinlerin yapısal biyoenformatiği
9
Genom veri analizi
10
Transkriptom veri analizi
11
Proteom veri analizi
12
Mıkrobiyom verı analızı
13
Ağ analizi ve sistemler biyolojisi
14
Biyoenformatikte öne çıkan hususlar ve güncel konular
Kaynak
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
Dersin Program Yeterliliklerine Katkısı
No
Program Yeterliliği
Katkı Düzeyi
1
2
3
4
5
1
Mühendislik alanında bilimsel araştırma yaparak bilgiye genişlemesine ve derinlemesine ulaşır, bilgiyi değerlendirir, yorumlar ve uygular.
X
2
Mühendislikte uygulanan güncel teknik ve yöntemler ile bunların kısıtları hakkında kapsamlı bilgi sahibidir ve mühendisliğin ilişki kurduğu disiplinler arası etkileşimi kavrayabilir.
X
3
Analitik, modelleme ve deneysel esaslı araştırmaları tasarlar ve uygular; bu süreçte karşılaşılan karmaşık durumları yorumlar, yeni ve özgün fikirler geliştirerek çözümler.
X
4
Sınırlı ya da eksik verileri kullanarak bilimsel yöntemlerle bilgiyi tamamlar ve uygular; değişik disiplinlere ait bilgileri bütünleştirir.
X
5
Mühendislik ile ilgili uzmanlık gerektiren bir çalışmayı bağımsız olarak yürütebilir.
X
6
Çok disiplinli takımlarda liderlik yapar, çözüm yaklaşımları geliştirir ve sorumluluk alır.
X
7
Mesleğinin yeni ve gelişmekte olan uygulamalarının farkındadır; gerektiğinde bunları inceler ve öğrenir.
X
8
Bilimsel bilgi birikimini yazılı ve sözlü olarak etkin bir şekilde ifade eder, en az bir yabancı dilde Avrupa Dil Portföyü B2 Genel Düzeyinde iletişim kurar ve iletişim teknolojilerini ileri düzeyde kullanır.
X
9
Mühendislik uygulamalarının sosyal ve çevresel boyutlarını betimler.
X
10
Verilerin toplanması, yorumlanması, duyurulması aşamalarında ve mesleki tüm etkinliklerde toplumsal, bilimsel ve etik değerleri gözetir.
